Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCFQ9NPI8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCFQ9NPI8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCFQ9NPI8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCFQ9NPI8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCFQ9NPI8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCFQ9NPI8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCFQ9NPI8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCFQ9NPI8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCFQ9NPI8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCFQ9NPI8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCFQ9NPI8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCFQ9NPI8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCFQ9NPI8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCFQ9NPI8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCFQ9NPI8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCFQ9NPI8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCFQ9NPI8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCFQ9NPI8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCFQ9NPI8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCFQ9NPI8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCFQ9NPI8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCFQ9NPI8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCFQ9NPI8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCFQ9NPI8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCFQ9NPI8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCFQ9NPI8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCFQ9NPI8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCFQ9NPI8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCFQ9NPI8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FANCFQ9NPI8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCFQ9NPI8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCFQ9NPI8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCFQ9NPI8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCFQ9NPI8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCFQ9NPI8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCFQ9NPI8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCFQ9NPI8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCFQ9NPI8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCFQ9NPI8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCFQ9NPI8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FANCFQ9NPI8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FANCFQ9NPI8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FANCFQ9NPI8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FANCFQ9NPI8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FANCFQ9NPI8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FANCFQ9NPI8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FANCFQ9NPI8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FANCFQ9NPI8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FANCFQ9NPI8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCFQ9NPI8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FANCFQ9NPI8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FANCFQ9NPI8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCFQ9NPI8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FANCFQ9NPI8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCFQ9NPI8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FANCFQ9NPI8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCFQ9NPI8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FANCFQ9NPI8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCFQ9NPI8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FANCFQ9NPI8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCFQ9NPI8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCFQ9NPI8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCFQ9NPI8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FANCFQ9NPI8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCFQ9NPI8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCFQ9NPI8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCFQ9NPI8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCFQ9NPI8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCFQ9NPI8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCFQ9NPI8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCFQ9NPI8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCFQ9NPI8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCFQ9NPI8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCFQ9NPI8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCFQ9NPI8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCFQ9NPI8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCFQ9NPI8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCFQ9NPI8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCFQ9NPI8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCFQ9NPI8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCFQ9NPI8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCFQ9NPI8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCFQ9NPI8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCFQ9NPI8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCFQ9NPI8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCFQ9NPI8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCFQ9NPI8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCFQ9NPI8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCFQ9NPI8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FANCFQ9NPI8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FANCFQ9NPI8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FANCFQ9NPI8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FANCFQ9NPI8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FANCFQ9NPI8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCFQ9NPI8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FANCFQ9NPI8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FANCFQ9NPI8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FANCFQ9NPI8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FANCFQ9NPI8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.7 ms