Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FANCFQ9NPI8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FANCFQ9NPI8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
FANCFQ9NPI8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FANCFQ9NPI8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FANCFQ9NPI8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FANCFQ9NPI8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FANCFQ9NPI8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FANCFQ9NPI8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FANCFQ9NPI8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FANCFQ9NPI8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FANCFQ9NPI8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FANCFQ9NPI8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FANCFQ9NPI8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FANCFQ9NPI8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FANCFQ9NPI8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FANCFQ9NPI8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FANCFQ9NPI8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCFQ9NPI8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FANCFQ9NPI8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FANCFQ9NPI8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FANCFQ9NPI8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FANCFQ9NPI8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FANCFQ9NPI8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FANCFQ9NPI8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCFQ9NPI8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCFQ9NPI8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FANCFQ9NPI8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FANCFQ9NPI8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FANCFQ9NPI8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FANCFQ9NPI8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FANCFQ9NPI8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FANCFQ9NPI8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FANCFQ9NPI8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FANCFQ9NPI8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FANCFQ9NPI8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FANCFQ9NPI8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FANCFQ9NPI8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FANCFQ9NPI8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCFQ9NPI8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCFQ9NPI8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FANCFQ9NPI8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FANCFQ9NPI8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FANCFQ9NPI8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FANCFQ9NPI8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FANCFQ9NPI8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FANCFQ9NPI8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FANCFQ9NPI8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FANCFQ9NPI8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FANCFQ9NPI8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FANCFQ9NPI8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FANCFQ9NPI8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
FANCFQ9NPI8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FANCFQ9NPI8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FANCFQ9NPI8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FANCFQ9NPI8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FANCFQ9NPI8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCFQ9NPI8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FANCFQ9NPI8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
FANCFQ9NPI8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FANCFQ9NPI8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FANCFQ9NPI8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FANCFQ9NPI8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
FANCFQ9NPI8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FANCFQ9NPI8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FANCFQ9NPI8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FANCFQ9NPI8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FANCFQ9NPI8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FANCFQ9NPI8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FANCFQ9NPI8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FANCFQ9NPI8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
FANCFQ9NPI8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FANCFQ9NPI8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FANCFQ9NPI8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FANCFQ9NPI8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FANCFQ9NPI8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FANCFQ9NPI8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FANCFQ9NPI8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FANCFQ9NPI8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FANCFQ9NPI8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FANCFQ9NPI8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FANCFQ9NPI8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FANCFQ9NPI8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FANCFQ9NPI8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FANCFQ9NPI8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FANCFQ9NPI8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FANCFQ9NPI8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FANCFQ9NPI8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FANCFQ9NPI8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FANCFQ9NPI8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FANCFQ9NPI8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FANCFQ9NPI8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCFQ9NPI8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCFQ9NPI8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCFQ9NPI8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCFQ9NPI8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FANCFQ9NPI8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FANCFQ9NPI8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FANCFQ9NPI8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FANCFQ9NPI8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms