Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP29Q9HBJ7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP29Q9HBJ7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP29Q9HBJ7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP29Q9HBJ7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP29Q9HBJ7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP29Q9HBJ7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP29Q9HBJ7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP29Q9HBJ7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP29Q9HBJ7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP29Q9HBJ7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP29Q9HBJ7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP29Q9HBJ7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP29Q9HBJ7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP29Q9HBJ7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP29Q9HBJ7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
USP29Q9HBJ7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP29Q9HBJ7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP29Q9HBJ7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP29Q9HBJ7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP29Q9HBJ7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP29Q9HBJ7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP29Q9HBJ7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP29Q9HBJ7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP29Q9HBJ7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP29Q9HBJ7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP29Q9HBJ7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP29Q9HBJ7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP29Q9HBJ7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP29Q9HBJ7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP29Q9HBJ7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
USP29Q9HBJ7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP29Q9HBJ7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP29Q9HBJ7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
USP29Q9HBJ7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP29Q9HBJ7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP29Q9HBJ7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP29Q9HBJ7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP29Q9HBJ7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP29Q9HBJ7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP29Q9HBJ7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP29Q9HBJ7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP29Q9HBJ7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP29Q9HBJ7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP29Q9HBJ7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
USP29Q9HBJ7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP29Q9HBJ7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
USP29Q9HBJ7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP29Q9HBJ7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP29Q9HBJ7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP29Q9HBJ7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP29Q9HBJ7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP29Q9HBJ7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP29Q9HBJ7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP29Q9HBJ7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
USP29Q9HBJ7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP29Q9HBJ7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP29Q9HBJ7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP29Q9HBJ7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP29Q9HBJ7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP29Q9HBJ7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP29Q9HBJ7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP29Q9HBJ7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP29Q9HBJ7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP29Q9HBJ7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP29Q9HBJ7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP29Q9HBJ7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP29Q9HBJ7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP29Q9HBJ7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP29Q9HBJ7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP29Q9HBJ7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP29Q9HBJ7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP29Q9HBJ7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP29Q9HBJ7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
USP29Q9HBJ7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP29Q9HBJ7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP29Q9HBJ7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP29Q9HBJ7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP29Q9HBJ7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP29Q9HBJ7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP29Q9HBJ7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP29Q9HBJ7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP29Q9HBJ7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP29Q9HBJ7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP29Q9HBJ7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP29Q9HBJ7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.57■■■□□ 2
USP29Q9HBJ7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP29Q9HBJ7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
USP29Q9HBJ7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP29Q9HBJ7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP29Q9HBJ7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
USP29Q9HBJ7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
USP29Q9HBJ7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
USP29Q9HBJ7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP29Q9HBJ7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP29Q9HBJ7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP29Q9HBJ7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP29Q9HBJ7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
USP29Q9HBJ7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
USP29Q9HBJ7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms