Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBH0

RHOF, Rho-related GTP-binding protein RhoF, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOFQ9HBH0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RHOFQ9HBH0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOFQ9HBH0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOFQ9HBH0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOFQ9HBH0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOFQ9HBH0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOFQ9HBH0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOFQ9HBH0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOFQ9HBH0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOFQ9HBH0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOFQ9HBH0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOFQ9HBH0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOFQ9HBH0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOFQ9HBH0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOFQ9HBH0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOFQ9HBH0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RHOFQ9HBH0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOFQ9HBH0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOFQ9HBH0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOFQ9HBH0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOFQ9HBH0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOFQ9HBH0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOFQ9HBH0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOFQ9HBH0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOFQ9HBH0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOFQ9HBH0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOFQ9HBH0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOFQ9HBH0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOFQ9HBH0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOFQ9HBH0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOFQ9HBH0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOFQ9HBH0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOFQ9HBH0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RHOFQ9HBH0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHOFQ9HBH0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHOFQ9HBH0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHOFQ9HBH0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHOFQ9HBH0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOFQ9HBH0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOFQ9HBH0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOFQ9HBH0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOFQ9HBH0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOFQ9HBH0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOFQ9HBH0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOFQ9HBH0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOFQ9HBH0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOFQ9HBH0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOFQ9HBH0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOFQ9HBH0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOFQ9HBH0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOFQ9HBH0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOFQ9HBH0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOFQ9HBH0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOFQ9HBH0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOFQ9HBH0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOFQ9HBH0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOFQ9HBH0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOFQ9HBH0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOFQ9HBH0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOFQ9HBH0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOFQ9HBH0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOFQ9HBH0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOFQ9HBH0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOFQ9HBH0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOFQ9HBH0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOFQ9HBH0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOFQ9HBH0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOFQ9HBH0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOFQ9HBH0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOFQ9HBH0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOFQ9HBH0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOFQ9HBH0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOFQ9HBH0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOFQ9HBH0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOFQ9HBH0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOFQ9HBH0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOFQ9HBH0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOFQ9HBH0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RHOFQ9HBH0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOFQ9HBH0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOFQ9HBH0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOFQ9HBH0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOFQ9HBH0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOFQ9HBH0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOFQ9HBH0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOFQ9HBH0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOFQ9HBH0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOFQ9HBH0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOFQ9HBH0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOFQ9HBH0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOFQ9HBH0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOFQ9HBH0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOFQ9HBH0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOFQ9HBH0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHOFQ9HBH0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHOFQ9HBH0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOFQ9HBH0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOFQ9HBH0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOFQ9HBH0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOFQ9HBH0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms