Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5V9

CXorf56, UPF0428 protein CXorf56, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf56Q9H5V9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CXorf56Q9H5V9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CXorf56Q9H5V9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CXorf56Q9H5V9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CXorf56Q9H5V9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CXorf56Q9H5V9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CXorf56Q9H5V9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CXorf56Q9H5V9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CXorf56Q9H5V9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CXorf56Q9H5V9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CXorf56Q9H5V9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CXorf56Q9H5V9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CXorf56Q9H5V9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CXorf56Q9H5V9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CXorf56Q9H5V9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CXorf56Q9H5V9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CXorf56Q9H5V9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CXorf56Q9H5V9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CXorf56Q9H5V9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CXorf56Q9H5V9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CXorf56Q9H5V9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CXorf56Q9H5V9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CXorf56Q9H5V9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CXorf56Q9H5V9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CXorf56Q9H5V9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CXorf56Q9H5V9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CXorf56Q9H5V9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CXorf56Q9H5V9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CXorf56Q9H5V9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CXorf56Q9H5V9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CXorf56Q9H5V9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CXorf56Q9H5V9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CXorf56Q9H5V9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CXorf56Q9H5V9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CXorf56Q9H5V9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CXorf56Q9H5V9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CXorf56Q9H5V9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CXorf56Q9H5V9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CXorf56Q9H5V9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CXorf56Q9H5V9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CXorf56Q9H5V9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CXorf56Q9H5V9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CXorf56Q9H5V9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CXorf56Q9H5V9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CXorf56Q9H5V9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CXorf56Q9H5V9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CXorf56Q9H5V9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CXorf56Q9H5V9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CXorf56Q9H5V9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CXorf56Q9H5V9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CXorf56Q9H5V9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CXorf56Q9H5V9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CXorf56Q9H5V9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CXorf56Q9H5V9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CXorf56Q9H5V9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CXorf56Q9H5V9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CXorf56Q9H5V9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CXorf56Q9H5V9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CXorf56Q9H5V9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CXorf56Q9H5V9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CXorf56Q9H5V9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CXorf56Q9H5V9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CXorf56Q9H5V9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CXorf56Q9H5V9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CXorf56Q9H5V9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CXorf56Q9H5V9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CXorf56Q9H5V9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CXorf56Q9H5V9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CXorf56Q9H5V9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CXorf56Q9H5V9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CXorf56Q9H5V9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CXorf56Q9H5V9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CXorf56Q9H5V9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CXorf56Q9H5V9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CXorf56Q9H5V9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CXorf56Q9H5V9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CXorf56Q9H5V9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXorf56Q9H5V9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXorf56Q9H5V9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXorf56Q9H5V9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXorf56Q9H5V9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXorf56Q9H5V9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXorf56Q9H5V9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXorf56Q9H5V9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CXorf56Q9H5V9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CXorf56Q9H5V9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CXorf56Q9H5V9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CXorf56Q9H5V9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CXorf56Q9H5V9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CXorf56Q9H5V9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CXorf56Q9H5V9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CXorf56Q9H5V9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CXorf56Q9H5V9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CXorf56Q9H5V9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CXorf56Q9H5V9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CXorf56Q9H5V9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CXorf56Q9H5V9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CXorf56Q9H5V9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CXorf56Q9H5V9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CXorf56Q9H5V9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms