Protein–RNA interactions for Protein: Q9H361

PABPC3, Polyadenylate-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC3Q9H361 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PABPC3Q9H361 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PABPC3Q9H361 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PABPC3Q9H361 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PABPC3Q9H361 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PABPC3Q9H361 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PABPC3Q9H361 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PABPC3Q9H361 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PABPC3Q9H361 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PABPC3Q9H361 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PABPC3Q9H361 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PABPC3Q9H361 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PABPC3Q9H361 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PABPC3Q9H361 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PABPC3Q9H361 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PABPC3Q9H361 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PABPC3Q9H361 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PABPC3Q9H361 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PABPC3Q9H361 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PABPC3Q9H361 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PABPC3Q9H361 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PABPC3Q9H361 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PABPC3Q9H361 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PABPC3Q9H361 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PABPC3Q9H361 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PABPC3Q9H361 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PABPC3Q9H361 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PABPC3Q9H361 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PABPC3Q9H361 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PABPC3Q9H361 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PABPC3Q9H361 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PABPC3Q9H361 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PABPC3Q9H361 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PABPC3Q9H361 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PABPC3Q9H361 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PABPC3Q9H361 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PABPC3Q9H361 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PABPC3Q9H361 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PABPC3Q9H361 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PABPC3Q9H361 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PABPC3Q9H361 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PABPC3Q9H361 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PABPC3Q9H361 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PABPC3Q9H361 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PABPC3Q9H361 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PABPC3Q9H361 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
PABPC3Q9H361 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PABPC3Q9H361 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PABPC3Q9H361 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PABPC3Q9H361 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PABPC3Q9H361 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PABPC3Q9H361 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PABPC3Q9H361 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PABPC3Q9H361 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PABPC3Q9H361 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PABPC3Q9H361 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PABPC3Q9H361 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PABPC3Q9H361 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PABPC3Q9H361 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PABPC3Q9H361 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PABPC3Q9H361 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PABPC3Q9H361 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PABPC3Q9H361 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PABPC3Q9H361 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PABPC3Q9H361 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PABPC3Q9H361 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PABPC3Q9H361 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PABPC3Q9H361 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PABPC3Q9H361 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PABPC3Q9H361 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PABPC3Q9H361 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PABPC3Q9H361 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PABPC3Q9H361 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PABPC3Q9H361 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PABPC3Q9H361 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PABPC3Q9H361 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PABPC3Q9H361 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PABPC3Q9H361 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PABPC3Q9H361 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PABPC3Q9H361 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PABPC3Q9H361 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PABPC3Q9H361 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PABPC3Q9H361 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PABPC3Q9H361 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PABPC3Q9H361 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PABPC3Q9H361 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PABPC3Q9H361 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PABPC3Q9H361 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PABPC3Q9H361 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PABPC3Q9H361 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PABPC3Q9H361 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PABPC3Q9H361 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PABPC3Q9H361 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PABPC3Q9H361 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PABPC3Q9H361 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PABPC3Q9H361 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PABPC3Q9H361 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PABPC3Q9H361 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PABPC3Q9H361 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PABPC3Q9H361 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 391.7 ms