Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L5

RASSF4, Ras association domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF4Q9H2L5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RASSF4Q9H2L5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RASSF4Q9H2L5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RASSF4Q9H2L5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RASSF4Q9H2L5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RASSF4Q9H2L5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RASSF4Q9H2L5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RASSF4Q9H2L5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RASSF4Q9H2L5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RASSF4Q9H2L5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RASSF4Q9H2L5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RASSF4Q9H2L5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RASSF4Q9H2L5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RASSF4Q9H2L5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RASSF4Q9H2L5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RASSF4Q9H2L5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RASSF4Q9H2L5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RASSF4Q9H2L5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RASSF4Q9H2L5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RASSF4Q9H2L5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RASSF4Q9H2L5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RASSF4Q9H2L5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RASSF4Q9H2L5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RASSF4Q9H2L5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RASSF4Q9H2L5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RASSF4Q9H2L5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RASSF4Q9H2L5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RASSF4Q9H2L5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RASSF4Q9H2L5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RASSF4Q9H2L5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RASSF4Q9H2L5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RASSF4Q9H2L5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RASSF4Q9H2L5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RASSF4Q9H2L5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RASSF4Q9H2L5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RASSF4Q9H2L5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RASSF4Q9H2L5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RASSF4Q9H2L5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RASSF4Q9H2L5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RASSF4Q9H2L5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RASSF4Q9H2L5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RASSF4Q9H2L5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RASSF4Q9H2L5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RASSF4Q9H2L5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RASSF4Q9H2L5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RASSF4Q9H2L5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RASSF4Q9H2L5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RASSF4Q9H2L5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RASSF4Q9H2L5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RASSF4Q9H2L5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RASSF4Q9H2L5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RASSF4Q9H2L5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RASSF4Q9H2L5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RASSF4Q9H2L5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RASSF4Q9H2L5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RASSF4Q9H2L5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RASSF4Q9H2L5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RASSF4Q9H2L5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RASSF4Q9H2L5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RASSF4Q9H2L5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RASSF4Q9H2L5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RASSF4Q9H2L5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RASSF4Q9H2L5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RASSF4Q9H2L5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RASSF4Q9H2L5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RASSF4Q9H2L5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RASSF4Q9H2L5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RASSF4Q9H2L5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RASSF4Q9H2L5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RASSF4Q9H2L5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RASSF4Q9H2L5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RASSF4Q9H2L5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RASSF4Q9H2L5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RASSF4Q9H2L5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RASSF4Q9H2L5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RASSF4Q9H2L5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RASSF4Q9H2L5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RASSF4Q9H2L5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RASSF4Q9H2L5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RASSF4Q9H2L5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RASSF4Q9H2L5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RASSF4Q9H2L5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RASSF4Q9H2L5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RASSF4Q9H2L5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RASSF4Q9H2L5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RASSF4Q9H2L5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RASSF4Q9H2L5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RASSF4Q9H2L5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RASSF4Q9H2L5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RASSF4Q9H2L5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RASSF4Q9H2L5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RASSF4Q9H2L5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RASSF4Q9H2L5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RASSF4Q9H2L5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RASSF4Q9H2L5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RASSF4Q9H2L5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RASSF4Q9H2L5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RASSF4Q9H2L5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RASSF4Q9H2L5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RASSF4Q9H2L5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms