Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C2

ARV1, Protein ARV1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARV1Q9H2C2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARV1Q9H2C2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARV1Q9H2C2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARV1Q9H2C2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARV1Q9H2C2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARV1Q9H2C2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARV1Q9H2C2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARV1Q9H2C2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARV1Q9H2C2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARV1Q9H2C2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARV1Q9H2C2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARV1Q9H2C2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARV1Q9H2C2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARV1Q9H2C2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARV1Q9H2C2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARV1Q9H2C2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARV1Q9H2C2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARV1Q9H2C2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARV1Q9H2C2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARV1Q9H2C2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARV1Q9H2C2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARV1Q9H2C2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARV1Q9H2C2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARV1Q9H2C2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARV1Q9H2C2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARV1Q9H2C2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARV1Q9H2C2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARV1Q9H2C2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARV1Q9H2C2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARV1Q9H2C2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARV1Q9H2C2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARV1Q9H2C2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARV1Q9H2C2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARV1Q9H2C2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARV1Q9H2C2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARV1Q9H2C2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARV1Q9H2C2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARV1Q9H2C2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARV1Q9H2C2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARV1Q9H2C2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARV1Q9H2C2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARV1Q9H2C2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARV1Q9H2C2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARV1Q9H2C2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARV1Q9H2C2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARV1Q9H2C2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARV1Q9H2C2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARV1Q9H2C2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARV1Q9H2C2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARV1Q9H2C2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARV1Q9H2C2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARV1Q9H2C2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARV1Q9H2C2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARV1Q9H2C2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARV1Q9H2C2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARV1Q9H2C2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARV1Q9H2C2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARV1Q9H2C2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARV1Q9H2C2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARV1Q9H2C2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARV1Q9H2C2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARV1Q9H2C2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARV1Q9H2C2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARV1Q9H2C2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARV1Q9H2C2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARV1Q9H2C2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARV1Q9H2C2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARV1Q9H2C2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARV1Q9H2C2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARV1Q9H2C2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARV1Q9H2C2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARV1Q9H2C2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARV1Q9H2C2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ARV1Q9H2C2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARV1Q9H2C2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARV1Q9H2C2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARV1Q9H2C2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ARV1Q9H2C2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARV1Q9H2C2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARV1Q9H2C2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARV1Q9H2C2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARV1Q9H2C2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARV1Q9H2C2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARV1Q9H2C2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARV1Q9H2C2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARV1Q9H2C2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARV1Q9H2C2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARV1Q9H2C2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARV1Q9H2C2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARV1Q9H2C2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARV1Q9H2C2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARV1Q9H2C2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARV1Q9H2C2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARV1Q9H2C2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARV1Q9H2C2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ARV1Q9H2C2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARV1Q9H2C2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARV1Q9H2C2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARV1Q9H2C2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARV1Q9H2C2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms