Protein–RNA interactions for Protein: Q9H015

SLC22A4, Solute carrier family 22 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A4Q9H015 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC22A4Q9H015 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC22A4Q9H015 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC22A4Q9H015 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC22A4Q9H015 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC22A4Q9H015 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC22A4Q9H015 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC22A4Q9H015 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC22A4Q9H015 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC22A4Q9H015 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC22A4Q9H015 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC22A4Q9H015 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC22A4Q9H015 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC22A4Q9H015 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC22A4Q9H015 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC22A4Q9H015 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC22A4Q9H015 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC22A4Q9H015 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC22A4Q9H015 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC22A4Q9H015 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC22A4Q9H015 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC22A4Q9H015 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC22A4Q9H015 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC22A4Q9H015 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC22A4Q9H015 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC22A4Q9H015 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC22A4Q9H015 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC22A4Q9H015 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC22A4Q9H015 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC22A4Q9H015 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC22A4Q9H015 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC22A4Q9H015 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC22A4Q9H015 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC22A4Q9H015 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC22A4Q9H015 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC22A4Q9H015 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC22A4Q9H015 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC22A4Q9H015 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC22A4Q9H015 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC22A4Q9H015 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC22A4Q9H015 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC22A4Q9H015 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC22A4Q9H015 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC22A4Q9H015 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC22A4Q9H015 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC22A4Q9H015 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC22A4Q9H015 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC22A4Q9H015 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC22A4Q9H015 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC22A4Q9H015 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC22A4Q9H015 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC22A4Q9H015 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC22A4Q9H015 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC22A4Q9H015 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC22A4Q9H015 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC22A4Q9H015 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC22A4Q9H015 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC22A4Q9H015 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC22A4Q9H015 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC22A4Q9H015 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC22A4Q9H015 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC22A4Q9H015 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC22A4Q9H015 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC22A4Q9H015 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC22A4Q9H015 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC22A4Q9H015 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC22A4Q9H015 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC22A4Q9H015 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC22A4Q9H015 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC22A4Q9H015 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC22A4Q9H015 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC22A4Q9H015 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC22A4Q9H015 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC22A4Q9H015 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC22A4Q9H015 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC22A4Q9H015 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC22A4Q9H015 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC22A4Q9H015 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC22A4Q9H015 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC22A4Q9H015 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC22A4Q9H015 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC22A4Q9H015 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC22A4Q9H015 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC22A4Q9H015 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC22A4Q9H015 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC22A4Q9H015 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC22A4Q9H015 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC22A4Q9H015 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC22A4Q9H015 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC22A4Q9H015 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC22A4Q9H015 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC22A4Q9H015 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC22A4Q9H015 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC22A4Q9H015 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC22A4Q9H015 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC22A4Q9H015 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC22A4Q9H015 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC22A4Q9H015 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC22A4Q9H015 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC22A4Q9H015 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms