Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SEMA4CQ9C0C4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA4CQ9C0C4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA4CQ9C0C4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA4CQ9C0C4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA4CQ9C0C4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA4CQ9C0C4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA4CQ9C0C4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA4CQ9C0C4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA4CQ9C0C4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEMA4CQ9C0C4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEMA4CQ9C0C4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEMA4CQ9C0C4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SEMA4CQ9C0C4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA4CQ9C0C4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA4CQ9C0C4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA4CQ9C0C4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA4CQ9C0C4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEMA4CQ9C0C4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEMA4CQ9C0C4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEMA4CQ9C0C4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA4CQ9C0C4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA4CQ9C0C4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA4CQ9C0C4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA4CQ9C0C4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA4CQ9C0C4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEMA4CQ9C0C4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SEMA4CQ9C0C4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEMA4CQ9C0C4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEMA4CQ9C0C4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEMA4CQ9C0C4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEMA4CQ9C0C4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEMA4CQ9C0C4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEMA4CQ9C0C4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA4CQ9C0C4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEMA4CQ9C0C4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEMA4CQ9C0C4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEMA4CQ9C0C4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEMA4CQ9C0C4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEMA4CQ9C0C4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEMA4CQ9C0C4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEMA4CQ9C0C4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEMA4CQ9C0C4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEMA4CQ9C0C4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEMA4CQ9C0C4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEMA4CQ9C0C4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEMA4CQ9C0C4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEMA4CQ9C0C4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SEMA4CQ9C0C4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEMA4CQ9C0C4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEMA4CQ9C0C4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEMA4CQ9C0C4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEMA4CQ9C0C4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA4CQ9C0C4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEMA4CQ9C0C4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEMA4CQ9C0C4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SEMA4CQ9C0C4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA4CQ9C0C4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEMA4CQ9C0C4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEMA4CQ9C0C4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEMA4CQ9C0C4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEMA4CQ9C0C4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEMA4CQ9C0C4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEMA4CQ9C0C4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEMA4CQ9C0C4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEMA4CQ9C0C4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEMA4CQ9C0C4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEMA4CQ9C0C4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEMA4CQ9C0C4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEMA4CQ9C0C4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEMA4CQ9C0C4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA4CQ9C0C4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA4CQ9C0C4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA4CQ9C0C4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA4CQ9C0C4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA4CQ9C0C4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA4CQ9C0C4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA4CQ9C0C4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA4CQ9C0C4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA4CQ9C0C4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA4CQ9C0C4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA4CQ9C0C4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA4CQ9C0C4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA4CQ9C0C4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA4CQ9C0C4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA4CQ9C0C4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA4CQ9C0C4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA4CQ9C0C4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA4CQ9C0C4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA4CQ9C0C4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA4CQ9C0C4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA4CQ9C0C4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA4CQ9C0C4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA4CQ9C0C4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA4CQ9C0C4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA4CQ9C0C4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA4CQ9C0C4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA4CQ9C0C4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA4CQ9C0C4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA4CQ9C0C4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 789 ms