Protein–RNA interactions for Protein: Q99954

SMR3A, Submaxillary gland androgen-regulated protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMR3AQ99954 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMR3AQ99954 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMR3AQ99954 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMR3AQ99954 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMR3AQ99954 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMR3AQ99954 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMR3AQ99954 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMR3AQ99954 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMR3AQ99954 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMR3AQ99954 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMR3AQ99954 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMR3AQ99954 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMR3AQ99954 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMR3AQ99954 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMR3AQ99954 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMR3AQ99954 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMR3AQ99954 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMR3AQ99954 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMR3AQ99954 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMR3AQ99954 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMR3AQ99954 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMR3AQ99954 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMR3AQ99954 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMR3AQ99954 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMR3AQ99954 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMR3AQ99954 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMR3AQ99954 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMR3AQ99954 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMR3AQ99954 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SMR3AQ99954 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SMR3AQ99954 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMR3AQ99954 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMR3AQ99954 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMR3AQ99954 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMR3AQ99954 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMR3AQ99954 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMR3AQ99954 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMR3AQ99954 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMR3AQ99954 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMR3AQ99954 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMR3AQ99954 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMR3AQ99954 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMR3AQ99954 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMR3AQ99954 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMR3AQ99954 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMR3AQ99954 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMR3AQ99954 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMR3AQ99954 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMR3AQ99954 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMR3AQ99954 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMR3AQ99954 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMR3AQ99954 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMR3AQ99954 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMR3AQ99954 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SMR3AQ99954 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMR3AQ99954 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMR3AQ99954 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMR3AQ99954 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SMR3AQ99954 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMR3AQ99954 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMR3AQ99954 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMR3AQ99954 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMR3AQ99954 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMR3AQ99954 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMR3AQ99954 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMR3AQ99954 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMR3AQ99954 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SMR3AQ99954 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SMR3AQ99954 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SMR3AQ99954 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMR3AQ99954 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMR3AQ99954 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMR3AQ99954 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMR3AQ99954 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMR3AQ99954 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMR3AQ99954 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMR3AQ99954 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMR3AQ99954 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMR3AQ99954 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMR3AQ99954 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMR3AQ99954 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMR3AQ99954 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMR3AQ99954 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMR3AQ99954 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMR3AQ99954 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMR3AQ99954 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMR3AQ99954 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMR3AQ99954 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SMR3AQ99954 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMR3AQ99954 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMR3AQ99954 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMR3AQ99954 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMR3AQ99954 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMR3AQ99954 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMR3AQ99954 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMR3AQ99954 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMR3AQ99954 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMR3AQ99954 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMR3AQ99954 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMR3AQ99954 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 347.6 ms