Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA0

PCDHB18P, Putative protocadherin beta-18, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB18PQ96TA0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PCDHB18PQ96TA0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PCDHB18PQ96TA0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCDHB18PQ96TA0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCDHB18PQ96TA0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCDHB18PQ96TA0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCDHB18PQ96TA0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCDHB18PQ96TA0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCDHB18PQ96TA0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCDHB18PQ96TA0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCDHB18PQ96TA0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCDHB18PQ96TA0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCDHB18PQ96TA0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCDHB18PQ96TA0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCDHB18PQ96TA0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCDHB18PQ96TA0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCDHB18PQ96TA0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCDHB18PQ96TA0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCDHB18PQ96TA0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCDHB18PQ96TA0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCDHB18PQ96TA0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCDHB18PQ96TA0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCDHB18PQ96TA0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCDHB18PQ96TA0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCDHB18PQ96TA0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCDHB18PQ96TA0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCDHB18PQ96TA0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCDHB18PQ96TA0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCDHB18PQ96TA0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PCDHB18PQ96TA0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCDHB18PQ96TA0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PCDHB18PQ96TA0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PCDHB18PQ96TA0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCDHB18PQ96TA0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PCDHB18PQ96TA0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCDHB18PQ96TA0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PCDHB18PQ96TA0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PCDHB18PQ96TA0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCDHB18PQ96TA0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCDHB18PQ96TA0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCDHB18PQ96TA0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCDHB18PQ96TA0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCDHB18PQ96TA0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCDHB18PQ96TA0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCDHB18PQ96TA0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCDHB18PQ96TA0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCDHB18PQ96TA0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCDHB18PQ96TA0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCDHB18PQ96TA0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCDHB18PQ96TA0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCDHB18PQ96TA0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCDHB18PQ96TA0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PCDHB18PQ96TA0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCDHB18PQ96TA0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCDHB18PQ96TA0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCDHB18PQ96TA0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCDHB18PQ96TA0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCDHB18PQ96TA0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCDHB18PQ96TA0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCDHB18PQ96TA0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCDHB18PQ96TA0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCDHB18PQ96TA0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCDHB18PQ96TA0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCDHB18PQ96TA0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCDHB18PQ96TA0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCDHB18PQ96TA0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCDHB18PQ96TA0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCDHB18PQ96TA0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PCDHB18PQ96TA0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCDHB18PQ96TA0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCDHB18PQ96TA0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCDHB18PQ96TA0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCDHB18PQ96TA0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCDHB18PQ96TA0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCDHB18PQ96TA0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PCDHB18PQ96TA0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCDHB18PQ96TA0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCDHB18PQ96TA0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCDHB18PQ96TA0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCDHB18PQ96TA0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCDHB18PQ96TA0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCDHB18PQ96TA0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCDHB18PQ96TA0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCDHB18PQ96TA0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCDHB18PQ96TA0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCDHB18PQ96TA0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCDHB18PQ96TA0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PCDHB18PQ96TA0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCDHB18PQ96TA0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCDHB18PQ96TA0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PCDHB18PQ96TA0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PCDHB18PQ96TA0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PCDHB18PQ96TA0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PCDHB18PQ96TA0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PCDHB18PQ96TA0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCDHB18PQ96TA0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCDHB18PQ96TA0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCDHB18PQ96TA0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCDHB18PQ96TA0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCDHB18PQ96TA0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms