Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TUBGCP5Q96RT8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TUBGCP5Q96RT8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TUBGCP5Q96RT8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TUBGCP5Q96RT8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TUBGCP5Q96RT8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TUBGCP5Q96RT8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TUBGCP5Q96RT8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TUBGCP5Q96RT8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TUBGCP5Q96RT8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TUBGCP5Q96RT8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TUBGCP5Q96RT8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TUBGCP5Q96RT8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TUBGCP5Q96RT8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TUBGCP5Q96RT8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TUBGCP5Q96RT8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TUBGCP5Q96RT8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TUBGCP5Q96RT8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TUBGCP5Q96RT8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TUBGCP5Q96RT8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TUBGCP5Q96RT8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TUBGCP5Q96RT8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TUBGCP5Q96RT8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TUBGCP5Q96RT8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TUBGCP5Q96RT8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TUBGCP5Q96RT8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TUBGCP5Q96RT8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TUBGCP5Q96RT8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TUBGCP5Q96RT8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TUBGCP5Q96RT8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TUBGCP5Q96RT8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TUBGCP5Q96RT8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TUBGCP5Q96RT8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TUBGCP5Q96RT8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TUBGCP5Q96RT8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TUBGCP5Q96RT8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TUBGCP5Q96RT8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TUBGCP5Q96RT8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TUBGCP5Q96RT8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TUBGCP5Q96RT8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TUBGCP5Q96RT8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TUBGCP5Q96RT8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TUBGCP5Q96RT8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TUBGCP5Q96RT8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TUBGCP5Q96RT8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TUBGCP5Q96RT8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TUBGCP5Q96RT8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TUBGCP5Q96RT8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TUBGCP5Q96RT8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TUBGCP5Q96RT8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TUBGCP5Q96RT8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TUBGCP5Q96RT8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TUBGCP5Q96RT8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TUBGCP5Q96RT8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TUBGCP5Q96RT8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TUBGCP5Q96RT8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TUBGCP5Q96RT8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBGCP5Q96RT8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBGCP5Q96RT8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TUBGCP5Q96RT8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TUBGCP5Q96RT8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TUBGCP5Q96RT8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TUBGCP5Q96RT8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TUBGCP5Q96RT8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TUBGCP5Q96RT8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TUBGCP5Q96RT8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TUBGCP5Q96RT8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TUBGCP5Q96RT8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TUBGCP5Q96RT8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TUBGCP5Q96RT8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TUBGCP5Q96RT8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBGCP5Q96RT8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TUBGCP5Q96RT8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUBGCP5Q96RT8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUBGCP5Q96RT8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUBGCP5Q96RT8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUBGCP5Q96RT8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUBGCP5Q96RT8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TUBGCP5Q96RT8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TUBGCP5Q96RT8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TUBGCP5Q96RT8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TUBGCP5Q96RT8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUBGCP5Q96RT8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TUBGCP5Q96RT8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TUBGCP5Q96RT8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TUBGCP5Q96RT8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUBGCP5Q96RT8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUBGCP5Q96RT8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUBGCP5Q96RT8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBGCP5Q96RT8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBGCP5Q96RT8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBGCP5Q96RT8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBGCP5Q96RT8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBGCP5Q96RT8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBGCP5Q96RT8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUBGCP5Q96RT8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBGCP5Q96RT8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBGCP5Q96RT8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUBGCP5Q96RT8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUBGCP5Q96RT8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms