Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SORCS2Q96PQ0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SORCS2Q96PQ0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SORCS2Q96PQ0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SORCS2Q96PQ0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SORCS2Q96PQ0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SORCS2Q96PQ0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SORCS2Q96PQ0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SORCS2Q96PQ0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SORCS2Q96PQ0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SORCS2Q96PQ0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SORCS2Q96PQ0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SORCS2Q96PQ0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SORCS2Q96PQ0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SORCS2Q96PQ0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SORCS2Q96PQ0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SORCS2Q96PQ0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SORCS2Q96PQ0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SORCS2Q96PQ0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SORCS2Q96PQ0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SORCS2Q96PQ0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SORCS2Q96PQ0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SORCS2Q96PQ0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SORCS2Q96PQ0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SORCS2Q96PQ0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SORCS2Q96PQ0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SORCS2Q96PQ0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SORCS2Q96PQ0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SORCS2Q96PQ0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SORCS2Q96PQ0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SORCS2Q96PQ0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SORCS2Q96PQ0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SORCS2Q96PQ0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SORCS2Q96PQ0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SORCS2Q96PQ0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SORCS2Q96PQ0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SORCS2Q96PQ0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SORCS2Q96PQ0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SORCS2Q96PQ0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SORCS2Q96PQ0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SORCS2Q96PQ0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SORCS2Q96PQ0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SORCS2Q96PQ0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SORCS2Q96PQ0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SORCS2Q96PQ0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SORCS2Q96PQ0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SORCS2Q96PQ0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SORCS2Q96PQ0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SORCS2Q96PQ0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SORCS2Q96PQ0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SORCS2Q96PQ0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SORCS2Q96PQ0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SORCS2Q96PQ0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SORCS2Q96PQ0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SORCS2Q96PQ0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SORCS2Q96PQ0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SORCS2Q96PQ0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SORCS2Q96PQ0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SORCS2Q96PQ0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SORCS2Q96PQ0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SORCS2Q96PQ0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SORCS2Q96PQ0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SORCS2Q96PQ0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SORCS2Q96PQ0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SORCS2Q96PQ0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SORCS2Q96PQ0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SORCS2Q96PQ0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORCS2Q96PQ0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SORCS2Q96PQ0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORCS2Q96PQ0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SORCS2Q96PQ0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SORCS2Q96PQ0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SORCS2Q96PQ0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SORCS2Q96PQ0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SORCS2Q96PQ0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SORCS2Q96PQ0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SORCS2Q96PQ0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SORCS2Q96PQ0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms