Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CCDC7Q96M83 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CCDC7Q96M83 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CCDC7Q96M83 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CCDC7Q96M83 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CCDC7Q96M83 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CCDC7Q96M83 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CCDC7Q96M83 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
CCDC7Q96M83 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CCDC7Q96M83 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
CCDC7Q96M83 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CCDC7Q96M83 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CCDC7Q96M83 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CCDC7Q96M83 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CCDC7Q96M83 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CCDC7Q96M83 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
CCDC7Q96M83 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
CCDC7Q96M83 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CCDC7Q96M83 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
CCDC7Q96M83 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CCDC7Q96M83 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CCDC7Q96M83 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CCDC7Q96M83 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CCDC7Q96M83 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CCDC7Q96M83 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CCDC7Q96M83 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
CCDC7Q96M83 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CCDC7Q96M83 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CCDC7Q96M83 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
CCDC7Q96M83 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CCDC7Q96M83 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CCDC7Q96M83 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
CCDC7Q96M83 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CCDC7Q96M83 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CCDC7Q96M83 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CCDC7Q96M83 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CCDC7Q96M83 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CCDC7Q96M83 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CCDC7Q96M83 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CCDC7Q96M83 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CCDC7Q96M83 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CCDC7Q96M83 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CCDC7Q96M83 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
CCDC7Q96M83 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CCDC7Q96M83 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CCDC7Q96M83 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CCDC7Q96M83 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CCDC7Q96M83 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CCDC7Q96M83 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CCDC7Q96M83 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CCDC7Q96M83 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CCDC7Q96M83 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CCDC7Q96M83 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
CCDC7Q96M83 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CCDC7Q96M83 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
CCDC7Q96M83 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CCDC7Q96M83 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CCDC7Q96M83 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CCDC7Q96M83 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CCDC7Q96M83 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CCDC7Q96M83 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CCDC7Q96M83 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CCDC7Q96M83 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CCDC7Q96M83 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CCDC7Q96M83 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CCDC7Q96M83 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CCDC7Q96M83 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CCDC7Q96M83 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CCDC7Q96M83 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CCDC7Q96M83 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
CCDC7Q96M83 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
CCDC7Q96M83 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CCDC7Q96M83 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CCDC7Q96M83 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CCDC7Q96M83 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
CCDC7Q96M83 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CCDC7Q96M83 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CCDC7Q96M83 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CCDC7Q96M83 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CCDC7Q96M83 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CCDC7Q96M83 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CCDC7Q96M83 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CCDC7Q96M83 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
CCDC7Q96M83 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
CCDC7Q96M83 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
CCDC7Q96M83 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CCDC7Q96M83 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CCDC7Q96M83 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CCDC7Q96M83 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CCDC7Q96M83 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CCDC7Q96M83 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CCDC7Q96M83 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CCDC7Q96M83 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
CCDC7Q96M83 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
CCDC7Q96M83 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
CCDC7Q96M83 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
CCDC7Q96M83 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CCDC7Q96M83 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CCDC7Q96M83 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CCDC7Q96M83 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms