Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CABS1Q96KC9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CABS1Q96KC9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CABS1Q96KC9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CABS1Q96KC9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CABS1Q96KC9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CABS1Q96KC9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CABS1Q96KC9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CABS1Q96KC9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CABS1Q96KC9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CABS1Q96KC9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CABS1Q96KC9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CABS1Q96KC9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CABS1Q96KC9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
CABS1Q96KC9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CABS1Q96KC9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CABS1Q96KC9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CABS1Q96KC9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CABS1Q96KC9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CABS1Q96KC9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CABS1Q96KC9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CABS1Q96KC9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CABS1Q96KC9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CABS1Q96KC9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CABS1Q96KC9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CABS1Q96KC9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CABS1Q96KC9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CABS1Q96KC9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CABS1Q96KC9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CABS1Q96KC9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CABS1Q96KC9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CABS1Q96KC9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CABS1Q96KC9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CABS1Q96KC9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CABS1Q96KC9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CABS1Q96KC9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CABS1Q96KC9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CABS1Q96KC9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CABS1Q96KC9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CABS1Q96KC9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CABS1Q96KC9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CABS1Q96KC9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CABS1Q96KC9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CABS1Q96KC9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CABS1Q96KC9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CABS1Q96KC9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CABS1Q96KC9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CABS1Q96KC9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CABS1Q96KC9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CABS1Q96KC9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CABS1Q96KC9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CABS1Q96KC9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CABS1Q96KC9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CABS1Q96KC9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CABS1Q96KC9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CABS1Q96KC9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CABS1Q96KC9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CABS1Q96KC9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CABS1Q96KC9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CABS1Q96KC9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CABS1Q96KC9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CABS1Q96KC9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CABS1Q96KC9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CABS1Q96KC9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CABS1Q96KC9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CABS1Q96KC9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CABS1Q96KC9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CABS1Q96KC9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CABS1Q96KC9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CABS1Q96KC9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CABS1Q96KC9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CABS1Q96KC9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CABS1Q96KC9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CABS1Q96KC9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CABS1Q96KC9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CABS1Q96KC9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CABS1Q96KC9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CABS1Q96KC9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CABS1Q96KC9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CABS1Q96KC9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CABS1Q96KC9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CABS1Q96KC9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CABS1Q96KC9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CABS1Q96KC9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CABS1Q96KC9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CABS1Q96KC9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CABS1Q96KC9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CABS1Q96KC9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CABS1Q96KC9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CABS1Q96KC9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CABS1Q96KC9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CABS1Q96KC9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CABS1Q96KC9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CABS1Q96KC9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CABS1Q96KC9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CABS1Q96KC9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CABS1Q96KC9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CABS1Q96KC9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CABS1Q96KC9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CABS1Q96KC9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms