Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
LRRIQ1Q96JM4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC43.01■■■■■ 4.48
LRRIQ1Q96JM4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
LRRIQ1Q96JM4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
LRRIQ1Q96JM4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
LRRIQ1Q96JM4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
LRRIQ1Q96JM4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
LRRIQ1Q96JM4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
LRRIQ1Q96JM4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.94■■■■■ 4.46
LRRIQ1Q96JM4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC42.93■■■■■ 4.46
LRRIQ1Q96JM4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC42.93■■■■■ 4.46
LRRIQ1Q96JM4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.93■■■■■ 4.46
LRRIQ1Q96JM4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC42.93■■■■■ 4.46
LRRIQ1Q96JM4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
LRRIQ1Q96JM4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.89■■■■■ 4.46
LRRIQ1Q96JM4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.89■■■■■ 4.46
LRRIQ1Q96JM4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC42.88■■■■■ 4.46
LRRIQ1Q96JM4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.88■■■■■ 4.46
LRRIQ1Q96JM4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC42.88■■■■■ 4.46
LRRIQ1Q96JM4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
LRRIQ1Q96JM4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC42.85■■■■■ 4.45
LRRIQ1Q96JM4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
LRRIQ1Q96JM4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC42.83■■■■■ 4.45
LRRIQ1Q96JM4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC42.81■■■■■ 4.44
LRRIQ1Q96JM4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
LRRIQ1Q96JM4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC42.77■■■■■ 4.44
LRRIQ1Q96JM4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.77■■■■■ 4.44
LRRIQ1Q96JM4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC42.77■■■■■ 4.44
LRRIQ1Q96JM4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC42.77■■■■■ 4.44
LRRIQ1Q96JM4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
LRRIQ1Q96JM4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
LRRIQ1Q96JM4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC42.74■■■■■ 4.43
LRRIQ1Q96JM4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
LRRIQ1Q96JM4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
LRRIQ1Q96JM4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
LRRIQ1Q96JM4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC42.7■■■■■ 4.43
LRRIQ1Q96JM4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC42.7■■■■■ 4.43
LRRIQ1Q96JM4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC42.68■■■■■ 4.42
LRRIQ1Q96JM4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
LRRIQ1Q96JM4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.68■■■■■ 4.42
LRRIQ1Q96JM4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
LRRIQ1Q96JM4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
LRRIQ1Q96JM4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
LRRIQ1Q96JM4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
LRRIQ1Q96JM4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
LRRIQ1Q96JM4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
LRRIQ1Q96JM4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
LRRIQ1Q96JM4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
LRRIQ1Q96JM4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC42.62■■■■■ 4.41
LRRIQ1Q96JM4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC42.62■■■■■ 4.41
LRRIQ1Q96JM4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
LRRIQ1Q96JM4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
LRRIQ1Q96JM4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
LRRIQ1Q96JM4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
LRRIQ1Q96JM4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
LRRIQ1Q96JM4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC42.57■■■■■ 4.41
LRRIQ1Q96JM4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
LRRIQ1Q96JM4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC42.55■■■■■ 4.4
LRRIQ1Q96JM4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
LRRIQ1Q96JM4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
LRRIQ1Q96JM4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.54■■■■■ 4.4
LRRIQ1Q96JM4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
LRRIQ1Q96JM4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
LRRIQ1Q96JM4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
LRRIQ1Q96JM4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
LRRIQ1Q96JM4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
LRRIQ1Q96JM4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC42.52■■■■■ 4.4
LRRIQ1Q96JM4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC42.52■■■■■ 4.4
LRRIQ1Q96JM4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
LRRIQ1Q96JM4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
LRRIQ1Q96JM4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
LRRIQ1Q96JM4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
LRRIQ1Q96JM4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
LRRIQ1Q96JM4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
LRRIQ1Q96JM4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC42.48■■■■■ 4.39
LRRIQ1Q96JM4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
LRRIQ1Q96JM4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
LRRIQ1Q96JM4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
LRRIQ1Q96JM4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
LRRIQ1Q96JM4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
LRRIQ1Q96JM4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
LRRIQ1Q96JM4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
LRRIQ1Q96JM4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
LRRIQ1Q96JM4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
LRRIQ1Q96JM4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC42.4■■■■■ 4.38
LRRIQ1Q96JM4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
LRRIQ1Q96JM4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
LRRIQ1Q96JM4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
LRRIQ1Q96JM4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
LRRIQ1Q96JM4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC42.36■■■■■ 4.37
LRRIQ1Q96JM4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
LRRIQ1Q96JM4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
LRRIQ1Q96JM4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC42.34■■■■■ 4.37
LRRIQ1Q96JM4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
LRRIQ1Q96JM4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
LRRIQ1Q96JM4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.36
LRRIQ1Q96JM4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC42.32■■■■■ 4.36
LRRIQ1Q96JM4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
LRRIQ1Q96JM4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
LRRIQ1Q96JM4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC42.31■■■■■ 4.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms