Protein–RNA interactions for Protein: Q96JL9

ZNF333, Zinc finger protein 333, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF333Q96JL9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ZNF333Q96JL9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
ZNF333Q96JL9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ZNF333Q96JL9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ZNF333Q96JL9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ZNF333Q96JL9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ZNF333Q96JL9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ZNF333Q96JL9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ZNF333Q96JL9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
ZNF333Q96JL9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ZNF333Q96JL9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ZNF333Q96JL9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ZNF333Q96JL9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ZNF333Q96JL9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ZNF333Q96JL9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ZNF333Q96JL9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ZNF333Q96JL9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ZNF333Q96JL9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ZNF333Q96JL9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
ZNF333Q96JL9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ZNF333Q96JL9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ZNF333Q96JL9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
ZNF333Q96JL9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
ZNF333Q96JL9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ZNF333Q96JL9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ZNF333Q96JL9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
ZNF333Q96JL9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
ZNF333Q96JL9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
ZNF333Q96JL9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
ZNF333Q96JL9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ZNF333Q96JL9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ZNF333Q96JL9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ZNF333Q96JL9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ZNF333Q96JL9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ZNF333Q96JL9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
ZNF333Q96JL9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ZNF333Q96JL9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ZNF333Q96JL9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ZNF333Q96JL9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ZNF333Q96JL9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ZNF333Q96JL9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ZNF333Q96JL9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ZNF333Q96JL9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ZNF333Q96JL9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ZNF333Q96JL9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ZNF333Q96JL9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ZNF333Q96JL9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ZNF333Q96JL9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ZNF333Q96JL9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
ZNF333Q96JL9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ZNF333Q96JL9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ZNF333Q96JL9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ZNF333Q96JL9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
ZNF333Q96JL9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ZNF333Q96JL9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ZNF333Q96JL9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ZNF333Q96JL9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ZNF333Q96JL9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ZNF333Q96JL9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
ZNF333Q96JL9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ZNF333Q96JL9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ZNF333Q96JL9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ZNF333Q96JL9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ZNF333Q96JL9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ZNF333Q96JL9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ZNF333Q96JL9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ZNF333Q96JL9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ZNF333Q96JL9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ZNF333Q96JL9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ZNF333Q96JL9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
ZNF333Q96JL9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
ZNF333Q96JL9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
ZNF333Q96JL9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
ZNF333Q96JL9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
ZNF333Q96JL9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ZNF333Q96JL9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ZNF333Q96JL9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ZNF333Q96JL9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ZNF333Q96JL9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ZNF333Q96JL9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ZNF333Q96JL9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ZNF333Q96JL9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ZNF333Q96JL9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ZNF333Q96JL9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZNF333Q96JL9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
ZNF333Q96JL9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZNF333Q96JL9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ZNF333Q96JL9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ZNF333Q96JL9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ZNF333Q96JL9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ZNF333Q96JL9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZNF333Q96JL9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZNF333Q96JL9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZNF333Q96JL9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ZNF333Q96JL9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ZNF333Q96JL9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ZNF333Q96JL9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ZNF333Q96JL9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ZNF333Q96JL9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ZNF333Q96JL9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.2 ms