Protein–RNA interactions for Protein: Q96H15

TIMD4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMD4Q96H15 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMD4Q96H15 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMD4Q96H15 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMD4Q96H15 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMD4Q96H15 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMD4Q96H15 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMD4Q96H15 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMD4Q96H15 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMD4Q96H15 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMD4Q96H15 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMD4Q96H15 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMD4Q96H15 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMD4Q96H15 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMD4Q96H15 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMD4Q96H15 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMD4Q96H15 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMD4Q96H15 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMD4Q96H15 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMD4Q96H15 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMD4Q96H15 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMD4Q96H15 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMD4Q96H15 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMD4Q96H15 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMD4Q96H15 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMD4Q96H15 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMD4Q96H15 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMD4Q96H15 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMD4Q96H15 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMD4Q96H15 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMD4Q96H15 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMD4Q96H15 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMD4Q96H15 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMD4Q96H15 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMD4Q96H15 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMD4Q96H15 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMD4Q96H15 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMD4Q96H15 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMD4Q96H15 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMD4Q96H15 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMD4Q96H15 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMD4Q96H15 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMD4Q96H15 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMD4Q96H15 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMD4Q96H15 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMD4Q96H15 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMD4Q96H15 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMD4Q96H15 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMD4Q96H15 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMD4Q96H15 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMD4Q96H15 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMD4Q96H15 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMD4Q96H15 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMD4Q96H15 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMD4Q96H15 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMD4Q96H15 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMD4Q96H15 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMD4Q96H15 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMD4Q96H15 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMD4Q96H15 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMD4Q96H15 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMD4Q96H15 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMD4Q96H15 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMD4Q96H15 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMD4Q96H15 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMD4Q96H15 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMD4Q96H15 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMD4Q96H15 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMD4Q96H15 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMD4Q96H15 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMD4Q96H15 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMD4Q96H15 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIMD4Q96H15 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIMD4Q96H15 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMD4Q96H15 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMD4Q96H15 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMD4Q96H15 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMD4Q96H15 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMD4Q96H15 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMD4Q96H15 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMD4Q96H15 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMD4Q96H15 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMD4Q96H15 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMD4Q96H15 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMD4Q96H15 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMD4Q96H15 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMD4Q96H15 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMD4Q96H15 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMD4Q96H15 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMD4Q96H15 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMD4Q96H15 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMD4Q96H15 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMD4Q96H15 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMD4Q96H15 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMD4Q96H15 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMD4Q96H15 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMD4Q96H15 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMD4Q96H15 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMD4Q96H15 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMD4Q96H15 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMD4Q96H15 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms