Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NXPE2Q96DL1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NXPE2Q96DL1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NXPE2Q96DL1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NXPE2Q96DL1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NXPE2Q96DL1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NXPE2Q96DL1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NXPE2Q96DL1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NXPE2Q96DL1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NXPE2Q96DL1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NXPE2Q96DL1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NXPE2Q96DL1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NXPE2Q96DL1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NXPE2Q96DL1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NXPE2Q96DL1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NXPE2Q96DL1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NXPE2Q96DL1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NXPE2Q96DL1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NXPE2Q96DL1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NXPE2Q96DL1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NXPE2Q96DL1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NXPE2Q96DL1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NXPE2Q96DL1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NXPE2Q96DL1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NXPE2Q96DL1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NXPE2Q96DL1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NXPE2Q96DL1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NXPE2Q96DL1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NXPE2Q96DL1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NXPE2Q96DL1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NXPE2Q96DL1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NXPE2Q96DL1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NXPE2Q96DL1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NXPE2Q96DL1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NXPE2Q96DL1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NXPE2Q96DL1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NXPE2Q96DL1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NXPE2Q96DL1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NXPE2Q96DL1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NXPE2Q96DL1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NXPE2Q96DL1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NXPE2Q96DL1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NXPE2Q96DL1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NXPE2Q96DL1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NXPE2Q96DL1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NXPE2Q96DL1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NXPE2Q96DL1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NXPE2Q96DL1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NXPE2Q96DL1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NXPE2Q96DL1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NXPE2Q96DL1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NXPE2Q96DL1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NXPE2Q96DL1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NXPE2Q96DL1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NXPE2Q96DL1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NXPE2Q96DL1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NXPE2Q96DL1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NXPE2Q96DL1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NXPE2Q96DL1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NXPE2Q96DL1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NXPE2Q96DL1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NXPE2Q96DL1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NXPE2Q96DL1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NXPE2Q96DL1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NXPE2Q96DL1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NXPE2Q96DL1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NXPE2Q96DL1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NXPE2Q96DL1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NXPE2Q96DL1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NXPE2Q96DL1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NXPE2Q96DL1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NXPE2Q96DL1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NXPE2Q96DL1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NXPE2Q96DL1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NXPE2Q96DL1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NXPE2Q96DL1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NXPE2Q96DL1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NXPE2Q96DL1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NXPE2Q96DL1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NXPE2Q96DL1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NXPE2Q96DL1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NXPE2Q96DL1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NXPE2Q96DL1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NXPE2Q96DL1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NXPE2Q96DL1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NXPE2Q96DL1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NXPE2Q96DL1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NXPE2Q96DL1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NXPE2Q96DL1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NXPE2Q96DL1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NXPE2Q96DL1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NXPE2Q96DL1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NXPE2Q96DL1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NXPE2Q96DL1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NXPE2Q96DL1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NXPE2Q96DL1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NXPE2Q96DL1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NXPE2Q96DL1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NXPE2Q96DL1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NXPE2Q96DL1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms