Protein–RNA interactions for Protein: Q96DE9

CXorf40B, Protein CXorf40B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf40BQ96DE9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CXorf40BQ96DE9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CXorf40BQ96DE9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CXorf40BQ96DE9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CXorf40BQ96DE9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CXorf40BQ96DE9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CXorf40BQ96DE9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CXorf40BQ96DE9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CXorf40BQ96DE9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CXorf40BQ96DE9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CXorf40BQ96DE9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CXorf40BQ96DE9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CXorf40BQ96DE9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CXorf40BQ96DE9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CXorf40BQ96DE9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CXorf40BQ96DE9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CXorf40BQ96DE9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CXorf40BQ96DE9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CXorf40BQ96DE9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CXorf40BQ96DE9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CXorf40BQ96DE9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CXorf40BQ96DE9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CXorf40BQ96DE9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CXorf40BQ96DE9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CXorf40BQ96DE9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CXorf40BQ96DE9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CXorf40BQ96DE9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CXorf40BQ96DE9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CXorf40BQ96DE9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CXorf40BQ96DE9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CXorf40BQ96DE9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CXorf40BQ96DE9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CXorf40BQ96DE9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CXorf40BQ96DE9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CXorf40BQ96DE9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CXorf40BQ96DE9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CXorf40BQ96DE9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CXorf40BQ96DE9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CXorf40BQ96DE9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CXorf40BQ96DE9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CXorf40BQ96DE9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CXorf40BQ96DE9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CXorf40BQ96DE9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CXorf40BQ96DE9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CXorf40BQ96DE9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CXorf40BQ96DE9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CXorf40BQ96DE9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CXorf40BQ96DE9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CXorf40BQ96DE9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CXorf40BQ96DE9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CXorf40BQ96DE9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CXorf40BQ96DE9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CXorf40BQ96DE9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CXorf40BQ96DE9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CXorf40BQ96DE9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CXorf40BQ96DE9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CXorf40BQ96DE9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CXorf40BQ96DE9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CXorf40BQ96DE9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CXorf40BQ96DE9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CXorf40BQ96DE9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CXorf40BQ96DE9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CXorf40BQ96DE9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CXorf40BQ96DE9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CXorf40BQ96DE9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CXorf40BQ96DE9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CXorf40BQ96DE9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CXorf40BQ96DE9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CXorf40BQ96DE9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CXorf40BQ96DE9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CXorf40BQ96DE9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CXorf40BQ96DE9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CXorf40BQ96DE9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CXorf40BQ96DE9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CXorf40BQ96DE9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CXorf40BQ96DE9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CXorf40BQ96DE9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CXorf40BQ96DE9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CXorf40BQ96DE9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CXorf40BQ96DE9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CXorf40BQ96DE9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CXorf40BQ96DE9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CXorf40BQ96DE9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CXorf40BQ96DE9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CXorf40BQ96DE9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CXorf40BQ96DE9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CXorf40BQ96DE9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CXorf40BQ96DE9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CXorf40BQ96DE9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CXorf40BQ96DE9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CXorf40BQ96DE9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CXorf40BQ96DE9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CXorf40BQ96DE9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CXorf40BQ96DE9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CXorf40BQ96DE9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CXorf40BQ96DE9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CXorf40BQ96DE9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CXorf40BQ96DE9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CXorf40BQ96DE9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CXorf40BQ96DE9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms