Protein–RNA interactions for Protein: Q96CD2

PPCDC, Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCDCQ96CD2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPCDCQ96CD2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPCDCQ96CD2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPCDCQ96CD2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPCDCQ96CD2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPCDCQ96CD2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPCDCQ96CD2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPCDCQ96CD2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPCDCQ96CD2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPCDCQ96CD2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPCDCQ96CD2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPCDCQ96CD2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPCDCQ96CD2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPCDCQ96CD2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPCDCQ96CD2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPCDCQ96CD2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPCDCQ96CD2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPCDCQ96CD2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPCDCQ96CD2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPCDCQ96CD2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPCDCQ96CD2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPCDCQ96CD2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPCDCQ96CD2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPCDCQ96CD2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPCDCQ96CD2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPCDCQ96CD2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPCDCQ96CD2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPCDCQ96CD2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPCDCQ96CD2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPCDCQ96CD2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPCDCQ96CD2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPCDCQ96CD2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPCDCQ96CD2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PPCDCQ96CD2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPCDCQ96CD2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPCDCQ96CD2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PPCDCQ96CD2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPCDCQ96CD2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPCDCQ96CD2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPCDCQ96CD2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPCDCQ96CD2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPCDCQ96CD2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPCDCQ96CD2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPCDCQ96CD2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPCDCQ96CD2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPCDCQ96CD2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPCDCQ96CD2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPCDCQ96CD2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPCDCQ96CD2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPCDCQ96CD2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPCDCQ96CD2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPCDCQ96CD2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPCDCQ96CD2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PPCDCQ96CD2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPCDCQ96CD2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PPCDCQ96CD2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPCDCQ96CD2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPCDCQ96CD2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPCDCQ96CD2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPCDCQ96CD2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPCDCQ96CD2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPCDCQ96CD2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPCDCQ96CD2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPCDCQ96CD2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPCDCQ96CD2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPCDCQ96CD2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PPCDCQ96CD2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPCDCQ96CD2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPCDCQ96CD2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPCDCQ96CD2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPCDCQ96CD2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPCDCQ96CD2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPCDCQ96CD2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPCDCQ96CD2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPCDCQ96CD2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPCDCQ96CD2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPCDCQ96CD2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPCDCQ96CD2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPCDCQ96CD2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPCDCQ96CD2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPCDCQ96CD2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPCDCQ96CD2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PPCDCQ96CD2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPCDCQ96CD2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPCDCQ96CD2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PPCDCQ96CD2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPCDCQ96CD2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPCDCQ96CD2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPCDCQ96CD2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPCDCQ96CD2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPCDCQ96CD2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPCDCQ96CD2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPCDCQ96CD2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPCDCQ96CD2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PPCDCQ96CD2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPCDCQ96CD2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPCDCQ96CD2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPCDCQ96CD2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPCDCQ96CD2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPCDCQ96CD2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms