Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD5

PHF21A, PHD finger protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21AQ96BD5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF21AQ96BD5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF21AQ96BD5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF21AQ96BD5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF21AQ96BD5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF21AQ96BD5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF21AQ96BD5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF21AQ96BD5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF21AQ96BD5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF21AQ96BD5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF21AQ96BD5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF21AQ96BD5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF21AQ96BD5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF21AQ96BD5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF21AQ96BD5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF21AQ96BD5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF21AQ96BD5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF21AQ96BD5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PHF21AQ96BD5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF21AQ96BD5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF21AQ96BD5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHF21AQ96BD5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF21AQ96BD5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF21AQ96BD5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF21AQ96BD5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF21AQ96BD5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF21AQ96BD5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHF21AQ96BD5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHF21AQ96BD5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHF21AQ96BD5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF21AQ96BD5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF21AQ96BD5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHF21AQ96BD5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHF21AQ96BD5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF21AQ96BD5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF21AQ96BD5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF21AQ96BD5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF21AQ96BD5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF21AQ96BD5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF21AQ96BD5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF21AQ96BD5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF21AQ96BD5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF21AQ96BD5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF21AQ96BD5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PHF21AQ96BD5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF21AQ96BD5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF21AQ96BD5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF21AQ96BD5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF21AQ96BD5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF21AQ96BD5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF21AQ96BD5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF21AQ96BD5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF21AQ96BD5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF21AQ96BD5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF21AQ96BD5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF21AQ96BD5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF21AQ96BD5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF21AQ96BD5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF21AQ96BD5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF21AQ96BD5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF21AQ96BD5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF21AQ96BD5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF21AQ96BD5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF21AQ96BD5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF21AQ96BD5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF21AQ96BD5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF21AQ96BD5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF21AQ96BD5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF21AQ96BD5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF21AQ96BD5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF21AQ96BD5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF21AQ96BD5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF21AQ96BD5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHF21AQ96BD5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHF21AQ96BD5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF21AQ96BD5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF21AQ96BD5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF21AQ96BD5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF21AQ96BD5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF21AQ96BD5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF21AQ96BD5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF21AQ96BD5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF21AQ96BD5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF21AQ96BD5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF21AQ96BD5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF21AQ96BD5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF21AQ96BD5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF21AQ96BD5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF21AQ96BD5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF21AQ96BD5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF21AQ96BD5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF21AQ96BD5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF21AQ96BD5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PHF21AQ96BD5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PHF21AQ96BD5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF21AQ96BD5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF21AQ96BD5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF21AQ96BD5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF21AQ96BD5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF21AQ96BD5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms