Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HGDQ93099 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HGDQ93099 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HGDQ93099 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HGDQ93099 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HGDQ93099 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HGDQ93099 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HGDQ93099 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HGDQ93099 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HGDQ93099 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HGDQ93099 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HGDQ93099 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HGDQ93099 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HGDQ93099 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HGDQ93099 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HGDQ93099 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HGDQ93099 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HGDQ93099 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HGDQ93099 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HGDQ93099 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HGDQ93099 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HGDQ93099 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HGDQ93099 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HGDQ93099 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HGDQ93099 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HGDQ93099 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HGDQ93099 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HGDQ93099 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HGDQ93099 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HGDQ93099 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HGDQ93099 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HGDQ93099 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HGDQ93099 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HGDQ93099 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HGDQ93099 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HGDQ93099 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HGDQ93099 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HGDQ93099 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HGDQ93099 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HGDQ93099 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HGDQ93099 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HGDQ93099 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HGDQ93099 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HGDQ93099 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HGDQ93099 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HGDQ93099 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HGDQ93099 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HGDQ93099 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HGDQ93099 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HGDQ93099 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HGDQ93099 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HGDQ93099 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HGDQ93099 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HGDQ93099 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HGDQ93099 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HGDQ93099 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HGDQ93099 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HGDQ93099 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HGDQ93099 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HGDQ93099 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HGDQ93099 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HGDQ93099 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HGDQ93099 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HGDQ93099 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HGDQ93099 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HGDQ93099 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HGDQ93099 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HGDQ93099 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HGDQ93099 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HGDQ93099 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HGDQ93099 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HGDQ93099 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HGDQ93099 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HGDQ93099 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HGDQ93099 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HGDQ93099 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HGDQ93099 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HGDQ93099 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HGDQ93099 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HGDQ93099 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HGDQ93099 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HGDQ93099 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HGDQ93099 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HGDQ93099 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HGDQ93099 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HGDQ93099 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HGDQ93099 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HGDQ93099 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HGDQ93099 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HGDQ93099 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HGDQ93099 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HGDQ93099 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HGDQ93099 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HGDQ93099 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HGDQ93099 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HGDQ93099 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HGDQ93099 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HGDQ93099 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HGDQ93099 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HGDQ93099 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms