Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP13Q92995 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP13Q92995 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP13Q92995 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP13Q92995 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
USP13Q92995 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP13Q92995 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP13Q92995 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP13Q92995 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP13Q92995 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP13Q92995 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP13Q92995 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP13Q92995 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP13Q92995 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP13Q92995 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP13Q92995 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP13Q92995 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP13Q92995 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP13Q92995 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP13Q92995 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP13Q92995 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP13Q92995 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP13Q92995 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP13Q92995 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP13Q92995 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
USP13Q92995 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP13Q92995 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP13Q92995 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP13Q92995 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP13Q92995 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP13Q92995 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP13Q92995 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP13Q92995 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP13Q92995 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP13Q92995 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP13Q92995 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP13Q92995 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP13Q92995 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP13Q92995 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP13Q92995 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
USP13Q92995 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP13Q92995 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP13Q92995 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP13Q92995 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP13Q92995 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP13Q92995 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP13Q92995 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP13Q92995 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP13Q92995 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP13Q92995 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP13Q92995 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP13Q92995 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP13Q92995 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP13Q92995 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP13Q92995 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP13Q92995 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP13Q92995 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP13Q92995 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP13Q92995 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP13Q92995 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP13Q92995 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP13Q92995 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP13Q92995 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP13Q92995 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
USP13Q92995 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP13Q92995 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP13Q92995 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP13Q92995 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP13Q92995 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP13Q92995 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP13Q92995 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP13Q92995 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP13Q92995 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP13Q92995 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP13Q92995 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP13Q92995 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP13Q92995 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP13Q92995 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP13Q92995 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP13Q92995 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP13Q92995 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP13Q92995 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP13Q92995 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP13Q92995 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP13Q92995 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP13Q92995 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP13Q92995 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP13Q92995 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP13Q92995 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP13Q92995 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
USP13Q92995 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
USP13Q92995 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
USP13Q92995 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP13Q92995 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP13Q92995 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP13Q92995 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP13Q92995 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP13Q92995 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP13Q92995 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP13Q92995 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms