Protein–RNA interactions for Protein: Q92570

NR4A3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A3Q92570 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NR4A3Q92570 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NR4A3Q92570 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR4A3Q92570 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR4A3Q92570 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR4A3Q92570 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NR4A3Q92570 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NR4A3Q92570 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NR4A3Q92570 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NR4A3Q92570 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NR4A3Q92570 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR4A3Q92570 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR4A3Q92570 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR4A3Q92570 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR4A3Q92570 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR4A3Q92570 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR4A3Q92570 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NR4A3Q92570 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NR4A3Q92570 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NR4A3Q92570 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NR4A3Q92570 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NR4A3Q92570 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NR4A3Q92570 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NR4A3Q92570 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NR4A3Q92570 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR4A3Q92570 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NR4A3Q92570 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NR4A3Q92570 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NR4A3Q92570 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NR4A3Q92570 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NR4A3Q92570 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR4A3Q92570 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR4A3Q92570 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NR4A3Q92570 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR4A3Q92570 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR4A3Q92570 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR4A3Q92570 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR4A3Q92570 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR4A3Q92570 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR4A3Q92570 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR4A3Q92570 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR4A3Q92570 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR4A3Q92570 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR4A3Q92570 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR4A3Q92570 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR4A3Q92570 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR4A3Q92570 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR4A3Q92570 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR4A3Q92570 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR4A3Q92570 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR4A3Q92570 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NR4A3Q92570 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR4A3Q92570 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR4A3Q92570 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR4A3Q92570 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR4A3Q92570 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR4A3Q92570 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR4A3Q92570 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR4A3Q92570 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR4A3Q92570 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR4A3Q92570 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR4A3Q92570 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR4A3Q92570 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR4A3Q92570 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR4A3Q92570 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NR4A3Q92570 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NR4A3Q92570 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NR4A3Q92570 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR4A3Q92570 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR4A3Q92570 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR4A3Q92570 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR4A3Q92570 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR4A3Q92570 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NR4A3Q92570 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NR4A3Q92570 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NR4A3Q92570 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NR4A3Q92570 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NR4A3Q92570 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NR4A3Q92570 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NR4A3Q92570 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NR4A3Q92570 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR4A3Q92570 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NR4A3Q92570 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR4A3Q92570 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NR4A3Q92570 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR4A3Q92570 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR4A3Q92570 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR4A3Q92570 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR4A3Q92570 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NR4A3Q92570 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NR4A3Q92570 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NR4A3Q92570 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR4A3Q92570 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NR4A3Q92570 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR4A3Q92570 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR4A3Q92570 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NR4A3Q92570 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR4A3Q92570 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR4A3Q92570 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NR4A3Q92570 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms