Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF8

DEDD2, DNA-binding death effector domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEDD2Q8WXF8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DEDD2Q8WXF8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEDD2Q8WXF8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEDD2Q8WXF8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEDD2Q8WXF8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEDD2Q8WXF8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEDD2Q8WXF8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEDD2Q8WXF8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DEDD2Q8WXF8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DEDD2Q8WXF8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DEDD2Q8WXF8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DEDD2Q8WXF8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DEDD2Q8WXF8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DEDD2Q8WXF8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DEDD2Q8WXF8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DEDD2Q8WXF8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DEDD2Q8WXF8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DEDD2Q8WXF8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DEDD2Q8WXF8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DEDD2Q8WXF8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DEDD2Q8WXF8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DEDD2Q8WXF8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DEDD2Q8WXF8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DEDD2Q8WXF8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DEDD2Q8WXF8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DEDD2Q8WXF8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DEDD2Q8WXF8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DEDD2Q8WXF8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DEDD2Q8WXF8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DEDD2Q8WXF8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DEDD2Q8WXF8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DEDD2Q8WXF8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DEDD2Q8WXF8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DEDD2Q8WXF8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DEDD2Q8WXF8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DEDD2Q8WXF8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DEDD2Q8WXF8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DEDD2Q8WXF8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DEDD2Q8WXF8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DEDD2Q8WXF8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DEDD2Q8WXF8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DEDD2Q8WXF8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DEDD2Q8WXF8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DEDD2Q8WXF8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DEDD2Q8WXF8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DEDD2Q8WXF8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DEDD2Q8WXF8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DEDD2Q8WXF8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DEDD2Q8WXF8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DEDD2Q8WXF8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DEDD2Q8WXF8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DEDD2Q8WXF8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DEDD2Q8WXF8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DEDD2Q8WXF8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DEDD2Q8WXF8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DEDD2Q8WXF8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DEDD2Q8WXF8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEDD2Q8WXF8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEDD2Q8WXF8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEDD2Q8WXF8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEDD2Q8WXF8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEDD2Q8WXF8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DEDD2Q8WXF8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DEDD2Q8WXF8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEDD2Q8WXF8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEDD2Q8WXF8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEDD2Q8WXF8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEDD2Q8WXF8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DEDD2Q8WXF8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DEDD2Q8WXF8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DEDD2Q8WXF8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DEDD2Q8WXF8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DEDD2Q8WXF8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DEDD2Q8WXF8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DEDD2Q8WXF8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DEDD2Q8WXF8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DEDD2Q8WXF8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DEDD2Q8WXF8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DEDD2Q8WXF8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DEDD2Q8WXF8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DEDD2Q8WXF8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DEDD2Q8WXF8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DEDD2Q8WXF8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DEDD2Q8WXF8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DEDD2Q8WXF8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DEDD2Q8WXF8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEDD2Q8WXF8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEDD2Q8WXF8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEDD2Q8WXF8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DEDD2Q8WXF8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DEDD2Q8WXF8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DEDD2Q8WXF8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DEDD2Q8WXF8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DEDD2Q8WXF8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DEDD2Q8WXF8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DEDD2Q8WXF8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DEDD2Q8WXF8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DEDD2Q8WXF8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DEDD2Q8WXF8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DEDD2Q8WXF8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms