Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUF8

FAM172A, Protein FAM172A, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM172AQ8WUF8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FAM172AQ8WUF8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FAM172AQ8WUF8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
FAM172AQ8WUF8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FAM172AQ8WUF8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FAM172AQ8WUF8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FAM172AQ8WUF8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FAM172AQ8WUF8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FAM172AQ8WUF8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FAM172AQ8WUF8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FAM172AQ8WUF8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FAM172AQ8WUF8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FAM172AQ8WUF8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FAM172AQ8WUF8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FAM172AQ8WUF8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM172AQ8WUF8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM172AQ8WUF8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM172AQ8WUF8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM172AQ8WUF8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FAM172AQ8WUF8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
FAM172AQ8WUF8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAM172AQ8WUF8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM172AQ8WUF8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM172AQ8WUF8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM172AQ8WUF8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM172AQ8WUF8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM172AQ8WUF8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM172AQ8WUF8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAM172AQ8WUF8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAM172AQ8WUF8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAM172AQ8WUF8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAM172AQ8WUF8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAM172AQ8WUF8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM172AQ8WUF8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM172AQ8WUF8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM172AQ8WUF8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FAM172AQ8WUF8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM172AQ8WUF8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM172AQ8WUF8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM172AQ8WUF8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM172AQ8WUF8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM172AQ8WUF8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM172AQ8WUF8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
FAM172AQ8WUF8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FAM172AQ8WUF8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FAM172AQ8WUF8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM172AQ8WUF8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM172AQ8WUF8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM172AQ8WUF8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM172AQ8WUF8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM172AQ8WUF8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FAM172AQ8WUF8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FAM172AQ8WUF8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FAM172AQ8WUF8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM172AQ8WUF8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM172AQ8WUF8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM172AQ8WUF8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM172AQ8WUF8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM172AQ8WUF8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM172AQ8WUF8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM172AQ8WUF8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM172AQ8WUF8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM172AQ8WUF8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM172AQ8WUF8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM172AQ8WUF8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM172AQ8WUF8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM172AQ8WUF8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM172AQ8WUF8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM172AQ8WUF8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM172AQ8WUF8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM172AQ8WUF8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM172AQ8WUF8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM172AQ8WUF8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM172AQ8WUF8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM172AQ8WUF8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM172AQ8WUF8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM172AQ8WUF8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM172AQ8WUF8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM172AQ8WUF8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FAM172AQ8WUF8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FAM172AQ8WUF8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FAM172AQ8WUF8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FAM172AQ8WUF8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM172AQ8WUF8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM172AQ8WUF8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM172AQ8WUF8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM172AQ8WUF8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM172AQ8WUF8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FAM172AQ8WUF8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FAM172AQ8WUF8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FAM172AQ8WUF8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FAM172AQ8WUF8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FAM172AQ8WUF8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FAM172AQ8WUF8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FAM172AQ8WUF8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FAM172AQ8WUF8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FAM172AQ8WUF8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM172AQ8WUF8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM172AQ8WUF8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM172AQ8WUF8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms