Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEC5

SH3RF2, Putative E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF2, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF2Q8TEC5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SH3RF2Q8TEC5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SH3RF2Q8TEC5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SH3RF2Q8TEC5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SH3RF2Q8TEC5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SH3RF2Q8TEC5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SH3RF2Q8TEC5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SH3RF2Q8TEC5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SH3RF2Q8TEC5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SH3RF2Q8TEC5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SH3RF2Q8TEC5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SH3RF2Q8TEC5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SH3RF2Q8TEC5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SH3RF2Q8TEC5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SH3RF2Q8TEC5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SH3RF2Q8TEC5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SH3RF2Q8TEC5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SH3RF2Q8TEC5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SH3RF2Q8TEC5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SH3RF2Q8TEC5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SH3RF2Q8TEC5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SH3RF2Q8TEC5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SH3RF2Q8TEC5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SH3RF2Q8TEC5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SH3RF2Q8TEC5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SH3RF2Q8TEC5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SH3RF2Q8TEC5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SH3RF2Q8TEC5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SH3RF2Q8TEC5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SH3RF2Q8TEC5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SH3RF2Q8TEC5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SH3RF2Q8TEC5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SH3RF2Q8TEC5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SH3RF2Q8TEC5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SH3RF2Q8TEC5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SH3RF2Q8TEC5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SH3RF2Q8TEC5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SH3RF2Q8TEC5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SH3RF2Q8TEC5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SH3RF2Q8TEC5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SH3RF2Q8TEC5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SH3RF2Q8TEC5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SH3RF2Q8TEC5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SH3RF2Q8TEC5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SH3RF2Q8TEC5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SH3RF2Q8TEC5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SH3RF2Q8TEC5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SH3RF2Q8TEC5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SH3RF2Q8TEC5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SH3RF2Q8TEC5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SH3RF2Q8TEC5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SH3RF2Q8TEC5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SH3RF2Q8TEC5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SH3RF2Q8TEC5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SH3RF2Q8TEC5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SH3RF2Q8TEC5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SH3RF2Q8TEC5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SH3RF2Q8TEC5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SH3RF2Q8TEC5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SH3RF2Q8TEC5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SH3RF2Q8TEC5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SH3RF2Q8TEC5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SH3RF2Q8TEC5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SH3RF2Q8TEC5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SH3RF2Q8TEC5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SH3RF2Q8TEC5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SH3RF2Q8TEC5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SH3RF2Q8TEC5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SH3RF2Q8TEC5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SH3RF2Q8TEC5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SH3RF2Q8TEC5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SH3RF2Q8TEC5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SH3RF2Q8TEC5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SH3RF2Q8TEC5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SH3RF2Q8TEC5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SH3RF2Q8TEC5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SH3RF2Q8TEC5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SH3RF2Q8TEC5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SH3RF2Q8TEC5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SH3RF2Q8TEC5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SH3RF2Q8TEC5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SH3RF2Q8TEC5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SH3RF2Q8TEC5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SH3RF2Q8TEC5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SH3RF2Q8TEC5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SH3RF2Q8TEC5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SH3RF2Q8TEC5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SH3RF2Q8TEC5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SH3RF2Q8TEC5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SH3RF2Q8TEC5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SH3RF2Q8TEC5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SH3RF2Q8TEC5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SH3RF2Q8TEC5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SH3RF2Q8TEC5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SH3RF2Q8TEC5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SH3RF2Q8TEC5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SH3RF2Q8TEC5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SH3RF2Q8TEC5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SH3RF2Q8TEC5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SH3RF2Q8TEC5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms