Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMEM35BQ8NCS4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMEM35BQ8NCS4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM35BQ8NCS4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM35BQ8NCS4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM35BQ8NCS4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM35BQ8NCS4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMEM35BQ8NCS4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMEM35BQ8NCS4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMEM35BQ8NCS4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMEM35BQ8NCS4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMEM35BQ8NCS4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMEM35BQ8NCS4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMEM35BQ8NCS4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMEM35BQ8NCS4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM35BQ8NCS4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM35BQ8NCS4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMEM35BQ8NCS4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMEM35BQ8NCS4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMEM35BQ8NCS4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMEM35BQ8NCS4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMEM35BQ8NCS4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMEM35BQ8NCS4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMEM35BQ8NCS4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM35BQ8NCS4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMEM35BQ8NCS4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMEM35BQ8NCS4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TMEM35BQ8NCS4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMEM35BQ8NCS4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TMEM35BQ8NCS4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMEM35BQ8NCS4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMEM35BQ8NCS4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMEM35BQ8NCS4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMEM35BQ8NCS4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMEM35BQ8NCS4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMEM35BQ8NCS4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMEM35BQ8NCS4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMEM35BQ8NCS4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMEM35BQ8NCS4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMEM35BQ8NCS4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMEM35BQ8NCS4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TMEM35BQ8NCS4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMEM35BQ8NCS4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMEM35BQ8NCS4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMEM35BQ8NCS4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMEM35BQ8NCS4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMEM35BQ8NCS4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMEM35BQ8NCS4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMEM35BQ8NCS4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMEM35BQ8NCS4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMEM35BQ8NCS4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMEM35BQ8NCS4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMEM35BQ8NCS4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMEM35BQ8NCS4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMEM35BQ8NCS4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMEM35BQ8NCS4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMEM35BQ8NCS4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TMEM35BQ8NCS4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMEM35BQ8NCS4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TMEM35BQ8NCS4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMEM35BQ8NCS4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMEM35BQ8NCS4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMEM35BQ8NCS4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMEM35BQ8NCS4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMEM35BQ8NCS4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMEM35BQ8NCS4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMEM35BQ8NCS4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMEM35BQ8NCS4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMEM35BQ8NCS4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMEM35BQ8NCS4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMEM35BQ8NCS4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM35BQ8NCS4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM35BQ8NCS4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM35BQ8NCS4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TMEM35BQ8NCS4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM35BQ8NCS4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM35BQ8NCS4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM35BQ8NCS4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM35BQ8NCS4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM35BQ8NCS4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM35BQ8NCS4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM35BQ8NCS4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMEM35BQ8NCS4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMEM35BQ8NCS4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMEM35BQ8NCS4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TMEM35BQ8NCS4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMEM35BQ8NCS4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM35BQ8NCS4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM35BQ8NCS4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM35BQ8NCS4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM35BQ8NCS4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM35BQ8NCS4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM35BQ8NCS4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM35BQ8NCS4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM35BQ8NCS4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
TMEM35BQ8NCS4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.12
TMEM35BQ8NCS4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM35BQ8NCS4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM35BQ8NCS4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM35BQ8NCS4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms