Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7Y1

KIRREL3-AS3, Putative uncharacterized protein KIRREL3-AS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KIRREL3-AS3Q8N7Y1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms