Protein–RNA interactions for Protein: Q8N567

ZCCHC9, Zinc finger CCHC domain-containing protein 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC9Q8N567 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZCCHC9Q8N567 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZCCHC9Q8N567 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZCCHC9Q8N567 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZCCHC9Q8N567 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZCCHC9Q8N567 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZCCHC9Q8N567 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ZCCHC9Q8N567 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZCCHC9Q8N567 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZCCHC9Q8N567 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZCCHC9Q8N567 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZCCHC9Q8N567 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZCCHC9Q8N567 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZCCHC9Q8N567 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZCCHC9Q8N567 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZCCHC9Q8N567 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZCCHC9Q8N567 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZCCHC9Q8N567 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZCCHC9Q8N567 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZCCHC9Q8N567 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZCCHC9Q8N567 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ZCCHC9Q8N567 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZCCHC9Q8N567 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZCCHC9Q8N567 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZCCHC9Q8N567 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZCCHC9Q8N567 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZCCHC9Q8N567 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZCCHC9Q8N567 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZCCHC9Q8N567 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZCCHC9Q8N567 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZCCHC9Q8N567 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZCCHC9Q8N567 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZCCHC9Q8N567 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZCCHC9Q8N567 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZCCHC9Q8N567 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZCCHC9Q8N567 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZCCHC9Q8N567 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZCCHC9Q8N567 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZCCHC9Q8N567 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZCCHC9Q8N567 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZCCHC9Q8N567 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZCCHC9Q8N567 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZCCHC9Q8N567 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZCCHC9Q8N567 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZCCHC9Q8N567 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZCCHC9Q8N567 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZCCHC9Q8N567 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZCCHC9Q8N567 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZCCHC9Q8N567 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ZCCHC9Q8N567 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZCCHC9Q8N567 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZCCHC9Q8N567 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZCCHC9Q8N567 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZCCHC9Q8N567 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZCCHC9Q8N567 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZCCHC9Q8N567 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ZCCHC9Q8N567 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZCCHC9Q8N567 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZCCHC9Q8N567 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZCCHC9Q8N567 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZCCHC9Q8N567 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZCCHC9Q8N567 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZCCHC9Q8N567 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZCCHC9Q8N567 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZCCHC9Q8N567 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZCCHC9Q8N567 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZCCHC9Q8N567 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZCCHC9Q8N567 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZCCHC9Q8N567 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZCCHC9Q8N567 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZCCHC9Q8N567 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZCCHC9Q8N567 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZCCHC9Q8N567 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ZCCHC9Q8N567 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZCCHC9Q8N567 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZCCHC9Q8N567 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZCCHC9Q8N567 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZCCHC9Q8N567 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ZCCHC9Q8N567 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ZCCHC9Q8N567 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZCCHC9Q8N567 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZCCHC9Q8N567 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZCCHC9Q8N567 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZCCHC9Q8N567 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZCCHC9Q8N567 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZCCHC9Q8N567 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZCCHC9Q8N567 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZCCHC9Q8N567 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZCCHC9Q8N567 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZCCHC9Q8N567 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZCCHC9Q8N567 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
ZCCHC9Q8N567 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ZCCHC9Q8N567 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZCCHC9Q8N567 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ZCCHC9Q8N567 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZCCHC9Q8N567 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZCCHC9Q8N567 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZCCHC9Q8N567 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZCCHC9Q8N567 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZCCHC9Q8N567 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms