Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RPAP2Q8IXW5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RPAP2Q8IXW5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RPAP2Q8IXW5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RPAP2Q8IXW5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RPAP2Q8IXW5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RPAP2Q8IXW5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
RPAP2Q8IXW5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RPAP2Q8IXW5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RPAP2Q8IXW5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RPAP2Q8IXW5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RPAP2Q8IXW5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RPAP2Q8IXW5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RPAP2Q8IXW5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RPAP2Q8IXW5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RPAP2Q8IXW5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RPAP2Q8IXW5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RPAP2Q8IXW5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
RPAP2Q8IXW5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RPAP2Q8IXW5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RPAP2Q8IXW5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RPAP2Q8IXW5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RPAP2Q8IXW5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RPAP2Q8IXW5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RPAP2Q8IXW5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RPAP2Q8IXW5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RPAP2Q8IXW5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
RPAP2Q8IXW5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
RPAP2Q8IXW5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RPAP2Q8IXW5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RPAP2Q8IXW5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RPAP2Q8IXW5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
RPAP2Q8IXW5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
RPAP2Q8IXW5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
RPAP2Q8IXW5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
RPAP2Q8IXW5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RPAP2Q8IXW5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RPAP2Q8IXW5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RPAP2Q8IXW5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RPAP2Q8IXW5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RPAP2Q8IXW5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
RPAP2Q8IXW5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RPAP2Q8IXW5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
RPAP2Q8IXW5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RPAP2Q8IXW5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
RPAP2Q8IXW5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RPAP2Q8IXW5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RPAP2Q8IXW5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RPAP2Q8IXW5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RPAP2Q8IXW5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RPAP2Q8IXW5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RPAP2Q8IXW5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RPAP2Q8IXW5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RPAP2Q8IXW5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RPAP2Q8IXW5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RPAP2Q8IXW5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RPAP2Q8IXW5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RPAP2Q8IXW5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RPAP2Q8IXW5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RPAP2Q8IXW5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
RPAP2Q8IXW5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RPAP2Q8IXW5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RPAP2Q8IXW5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RPAP2Q8IXW5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
RPAP2Q8IXW5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RPAP2Q8IXW5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RPAP2Q8IXW5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RPAP2Q8IXW5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
RPAP2Q8IXW5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RPAP2Q8IXW5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RPAP2Q8IXW5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RPAP2Q8IXW5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RPAP2Q8IXW5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RPAP2Q8IXW5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RPAP2Q8IXW5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RPAP2Q8IXW5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RPAP2Q8IXW5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RPAP2Q8IXW5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RPAP2Q8IXW5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RPAP2Q8IXW5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RPAP2Q8IXW5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RPAP2Q8IXW5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
RPAP2Q8IXW5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
RPAP2Q8IXW5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RPAP2Q8IXW5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RPAP2Q8IXW5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RPAP2Q8IXW5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RPAP2Q8IXW5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RPAP2Q8IXW5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
RPAP2Q8IXW5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RPAP2Q8IXW5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RPAP2Q8IXW5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RPAP2Q8IXW5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RPAP2Q8IXW5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RPAP2Q8IXW5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RPAP2Q8IXW5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RPAP2Q8IXW5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RPAP2Q8IXW5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RPAP2Q8IXW5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RPAP2Q8IXW5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 231.4 ms