Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX94

CTAGE4, cTAGE family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE4Q8IX94 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTAGE4Q8IX94 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTAGE4Q8IX94 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTAGE4Q8IX94 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTAGE4Q8IX94 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTAGE4Q8IX94 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTAGE4Q8IX94 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTAGE4Q8IX94 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTAGE4Q8IX94 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTAGE4Q8IX94 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTAGE4Q8IX94 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTAGE4Q8IX94 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTAGE4Q8IX94 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTAGE4Q8IX94 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTAGE4Q8IX94 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTAGE4Q8IX94 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTAGE4Q8IX94 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CTAGE4Q8IX94 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CTAGE4Q8IX94 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CTAGE4Q8IX94 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTAGE4Q8IX94 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CTAGE4Q8IX94 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTAGE4Q8IX94 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTAGE4Q8IX94 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTAGE4Q8IX94 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTAGE4Q8IX94 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTAGE4Q8IX94 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTAGE4Q8IX94 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTAGE4Q8IX94 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTAGE4Q8IX94 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTAGE4Q8IX94 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTAGE4Q8IX94 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTAGE4Q8IX94 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CTAGE4Q8IX94 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CTAGE4Q8IX94 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CTAGE4Q8IX94 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CTAGE4Q8IX94 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTAGE4Q8IX94 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CTAGE4Q8IX94 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTAGE4Q8IX94 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTAGE4Q8IX94 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTAGE4Q8IX94 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTAGE4Q8IX94 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTAGE4Q8IX94 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTAGE4Q8IX94 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTAGE4Q8IX94 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTAGE4Q8IX94 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTAGE4Q8IX94 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTAGE4Q8IX94 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTAGE4Q8IX94 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTAGE4Q8IX94 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTAGE4Q8IX94 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CTAGE4Q8IX94 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTAGE4Q8IX94 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTAGE4Q8IX94 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTAGE4Q8IX94 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTAGE4Q8IX94 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTAGE4Q8IX94 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTAGE4Q8IX94 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTAGE4Q8IX94 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTAGE4Q8IX94 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTAGE4Q8IX94 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTAGE4Q8IX94 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CTAGE4Q8IX94 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CTAGE4Q8IX94 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CTAGE4Q8IX94 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTAGE4Q8IX94 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTAGE4Q8IX94 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTAGE4Q8IX94 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTAGE4Q8IX94 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTAGE4Q8IX94 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTAGE4Q8IX94 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTAGE4Q8IX94 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTAGE4Q8IX94 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTAGE4Q8IX94 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTAGE4Q8IX94 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTAGE4Q8IX94 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTAGE4Q8IX94 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTAGE4Q8IX94 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTAGE4Q8IX94 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTAGE4Q8IX94 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTAGE4Q8IX94 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTAGE4Q8IX94 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTAGE4Q8IX94 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTAGE4Q8IX94 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTAGE4Q8IX94 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CTAGE4Q8IX94 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTAGE4Q8IX94 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTAGE4Q8IX94 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTAGE4Q8IX94 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTAGE4Q8IX94 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTAGE4Q8IX94 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTAGE4Q8IX94 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTAGE4Q8IX94 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTAGE4Q8IX94 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTAGE4Q8IX94 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTAGE4Q8IX94 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTAGE4Q8IX94 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTAGE4Q8IX94 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTAGE4Q8IX94 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms