Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX05

CD302, CD302 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD302Q8IX05 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CD302Q8IX05 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CD302Q8IX05 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CD302Q8IX05 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CD302Q8IX05 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CD302Q8IX05 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CD302Q8IX05 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CD302Q8IX05 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CD302Q8IX05 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CD302Q8IX05 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CD302Q8IX05 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CD302Q8IX05 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CD302Q8IX05 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CD302Q8IX05 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CD302Q8IX05 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CD302Q8IX05 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CD302Q8IX05 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CD302Q8IX05 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CD302Q8IX05 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CD302Q8IX05 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CD302Q8IX05 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CD302Q8IX05 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CD302Q8IX05 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CD302Q8IX05 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CD302Q8IX05 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CD302Q8IX05 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CD302Q8IX05 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CD302Q8IX05 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CD302Q8IX05 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CD302Q8IX05 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CD302Q8IX05 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CD302Q8IX05 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CD302Q8IX05 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CD302Q8IX05 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CD302Q8IX05 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CD302Q8IX05 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CD302Q8IX05 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CD302Q8IX05 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CD302Q8IX05 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CD302Q8IX05 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CD302Q8IX05 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CD302Q8IX05 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CD302Q8IX05 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CD302Q8IX05 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CD302Q8IX05 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CD302Q8IX05 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CD302Q8IX05 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CD302Q8IX05 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CD302Q8IX05 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CD302Q8IX05 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CD302Q8IX05 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CD302Q8IX05 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CD302Q8IX05 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CD302Q8IX05 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CD302Q8IX05 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CD302Q8IX05 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CD302Q8IX05 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CD302Q8IX05 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CD302Q8IX05 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CD302Q8IX05 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CD302Q8IX05 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CD302Q8IX05 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CD302Q8IX05 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CD302Q8IX05 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CD302Q8IX05 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CD302Q8IX05 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CD302Q8IX05 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CD302Q8IX05 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CD302Q8IX05 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CD302Q8IX05 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CD302Q8IX05 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CD302Q8IX05 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CD302Q8IX05 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CD302Q8IX05 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CD302Q8IX05 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CD302Q8IX05 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CD302Q8IX05 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CD302Q8IX05 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CD302Q8IX05 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CD302Q8IX05 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CD302Q8IX05 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CD302Q8IX05 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CD302Q8IX05 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CD302Q8IX05 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CD302Q8IX05 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CD302Q8IX05 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CD302Q8IX05 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CD302Q8IX05 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CD302Q8IX05 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CD302Q8IX05 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CD302Q8IX05 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CD302Q8IX05 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CD302Q8IX05 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CD302Q8IX05 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CD302Q8IX05 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CD302Q8IX05 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CD302Q8IX05 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CD302Q8IX05 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CD302Q8IX05 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CD302Q8IX05 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms