Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM48Q8IWZ4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM48Q8IWZ4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM48Q8IWZ4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM48Q8IWZ4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM48Q8IWZ4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM48Q8IWZ4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM48Q8IWZ4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM48Q8IWZ4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM48Q8IWZ4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM48Q8IWZ4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM48Q8IWZ4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM48Q8IWZ4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM48Q8IWZ4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM48Q8IWZ4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM48Q8IWZ4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM48Q8IWZ4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM48Q8IWZ4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM48Q8IWZ4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM48Q8IWZ4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM48Q8IWZ4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM48Q8IWZ4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM48Q8IWZ4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM48Q8IWZ4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM48Q8IWZ4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIM48Q8IWZ4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM48Q8IWZ4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM48Q8IWZ4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM48Q8IWZ4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM48Q8IWZ4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM48Q8IWZ4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM48Q8IWZ4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM48Q8IWZ4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM48Q8IWZ4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM48Q8IWZ4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM48Q8IWZ4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM48Q8IWZ4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM48Q8IWZ4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM48Q8IWZ4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM48Q8IWZ4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM48Q8IWZ4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM48Q8IWZ4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM48Q8IWZ4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM48Q8IWZ4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM48Q8IWZ4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM48Q8IWZ4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM48Q8IWZ4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM48Q8IWZ4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM48Q8IWZ4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM48Q8IWZ4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM48Q8IWZ4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM48Q8IWZ4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM48Q8IWZ4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM48Q8IWZ4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM48Q8IWZ4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM48Q8IWZ4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM48Q8IWZ4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM48Q8IWZ4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM48Q8IWZ4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM48Q8IWZ4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM48Q8IWZ4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM48Q8IWZ4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM48Q8IWZ4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM48Q8IWZ4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM48Q8IWZ4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM48Q8IWZ4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM48Q8IWZ4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM48Q8IWZ4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM48Q8IWZ4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM48Q8IWZ4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM48Q8IWZ4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM48Q8IWZ4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM48Q8IWZ4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM48Q8IWZ4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM48Q8IWZ4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM48Q8IWZ4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM48Q8IWZ4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM48Q8IWZ4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM48Q8IWZ4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM48Q8IWZ4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM48Q8IWZ4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM48Q8IWZ4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM48Q8IWZ4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM48Q8IWZ4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM48Q8IWZ4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM48Q8IWZ4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM48Q8IWZ4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM48Q8IWZ4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM48Q8IWZ4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM48Q8IWZ4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM48Q8IWZ4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM48Q8IWZ4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM48Q8IWZ4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM48Q8IWZ4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM48Q8IWZ4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM48Q8IWZ4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM48Q8IWZ4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM48Q8IWZ4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM48Q8IWZ4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM48Q8IWZ4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms