Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVF7

FMNL3, Formin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMNL3Q8IVF7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FMNL3Q8IVF7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FMNL3Q8IVF7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FMNL3Q8IVF7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FMNL3Q8IVF7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
FMNL3Q8IVF7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FMNL3Q8IVF7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FMNL3Q8IVF7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FMNL3Q8IVF7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FMNL3Q8IVF7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FMNL3Q8IVF7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FMNL3Q8IVF7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FMNL3Q8IVF7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FMNL3Q8IVF7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FMNL3Q8IVF7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
FMNL3Q8IVF7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FMNL3Q8IVF7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FMNL3Q8IVF7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FMNL3Q8IVF7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FMNL3Q8IVF7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FMNL3Q8IVF7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FMNL3Q8IVF7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FMNL3Q8IVF7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FMNL3Q8IVF7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FMNL3Q8IVF7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
FMNL3Q8IVF7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FMNL3Q8IVF7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FMNL3Q8IVF7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FMNL3Q8IVF7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FMNL3Q8IVF7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FMNL3Q8IVF7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FMNL3Q8IVF7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FMNL3Q8IVF7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FMNL3Q8IVF7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FMNL3Q8IVF7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FMNL3Q8IVF7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FMNL3Q8IVF7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FMNL3Q8IVF7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FMNL3Q8IVF7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FMNL3Q8IVF7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29■■■□□ 2.23
FMNL3Q8IVF7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FMNL3Q8IVF7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FMNL3Q8IVF7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FMNL3Q8IVF7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FMNL3Q8IVF7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FMNL3Q8IVF7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FMNL3Q8IVF7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FMNL3Q8IVF7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FMNL3Q8IVF7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FMNL3Q8IVF7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FMNL3Q8IVF7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FMNL3Q8IVF7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FMNL3Q8IVF7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FMNL3Q8IVF7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FMNL3Q8IVF7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FMNL3Q8IVF7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FMNL3Q8IVF7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FMNL3Q8IVF7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FMNL3Q8IVF7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FMNL3Q8IVF7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FMNL3Q8IVF7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FMNL3Q8IVF7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FMNL3Q8IVF7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FMNL3Q8IVF7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
FMNL3Q8IVF7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
FMNL3Q8IVF7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FMNL3Q8IVF7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
FMNL3Q8IVF7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FMNL3Q8IVF7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FMNL3Q8IVF7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
FMNL3Q8IVF7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FMNL3Q8IVF7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FMNL3Q8IVF7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FMNL3Q8IVF7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FMNL3Q8IVF7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FMNL3Q8IVF7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FMNL3Q8IVF7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FMNL3Q8IVF7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FMNL3Q8IVF7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
FMNL3Q8IVF7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FMNL3Q8IVF7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FMNL3Q8IVF7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FMNL3Q8IVF7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FMNL3Q8IVF7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FMNL3Q8IVF7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FMNL3Q8IVF7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FMNL3Q8IVF7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FMNL3Q8IVF7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
FMNL3Q8IVF7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FMNL3Q8IVF7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FMNL3Q8IVF7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FMNL3Q8IVF7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FMNL3Q8IVF7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FMNL3Q8IVF7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FMNL3Q8IVF7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FMNL3Q8IVF7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FMNL3Q8IVF7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FMNL3Q8IVF7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FMNL3Q8IVF7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FMNL3Q8IVF7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms