Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU80

TMPRSS6, Transmembrane protease serine 6, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS6Q8IU80 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMPRSS6Q8IU80 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMPRSS6Q8IU80 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMPRSS6Q8IU80 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TMPRSS6Q8IU80 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMPRSS6Q8IU80 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMPRSS6Q8IU80 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMPRSS6Q8IU80 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMPRSS6Q8IU80 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMPRSS6Q8IU80 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMPRSS6Q8IU80 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMPRSS6Q8IU80 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMPRSS6Q8IU80 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMPRSS6Q8IU80 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMPRSS6Q8IU80 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMPRSS6Q8IU80 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMPRSS6Q8IU80 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMPRSS6Q8IU80 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMPRSS6Q8IU80 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMPRSS6Q8IU80 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMPRSS6Q8IU80 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
TMPRSS6Q8IU80 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMPRSS6Q8IU80 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMPRSS6Q8IU80 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMPRSS6Q8IU80 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMPRSS6Q8IU80 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMPRSS6Q8IU80 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMPRSS6Q8IU80 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMPRSS6Q8IU80 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMPRSS6Q8IU80 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TMPRSS6Q8IU80 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMPRSS6Q8IU80 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMPRSS6Q8IU80 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMPRSS6Q8IU80 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMPRSS6Q8IU80 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMPRSS6Q8IU80 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMPRSS6Q8IU80 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMPRSS6Q8IU80 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMPRSS6Q8IU80 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMPRSS6Q8IU80 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMPRSS6Q8IU80 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMPRSS6Q8IU80 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMPRSS6Q8IU80 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TMPRSS6Q8IU80 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMPRSS6Q8IU80 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMPRSS6Q8IU80 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMPRSS6Q8IU80 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMPRSS6Q8IU80 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMPRSS6Q8IU80 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMPRSS6Q8IU80 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMPRSS6Q8IU80 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMPRSS6Q8IU80 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMPRSS6Q8IU80 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMPRSS6Q8IU80 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TMPRSS6Q8IU80 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMPRSS6Q8IU80 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMPRSS6Q8IU80 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMPRSS6Q8IU80 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMPRSS6Q8IU80 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMPRSS6Q8IU80 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMPRSS6Q8IU80 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TMPRSS6Q8IU80 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TMPRSS6Q8IU80 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TMPRSS6Q8IU80 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMPRSS6Q8IU80 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMPRSS6Q8IU80 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMPRSS6Q8IU80 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMPRSS6Q8IU80 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMPRSS6Q8IU80 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMPRSS6Q8IU80 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMPRSS6Q8IU80 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TMPRSS6Q8IU80 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMPRSS6Q8IU80 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMPRSS6Q8IU80 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TMPRSS6Q8IU80 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMPRSS6Q8IU80 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMPRSS6Q8IU80 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TMPRSS6Q8IU80 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TMPRSS6Q8IU80 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
TMPRSS6Q8IU80 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMPRSS6Q8IU80 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TMPRSS6Q8IU80 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMPRSS6Q8IU80 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMPRSS6Q8IU80 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMPRSS6Q8IU80 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMPRSS6Q8IU80 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMPRSS6Q8IU80 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMPRSS6Q8IU80 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMPRSS6Q8IU80 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TMPRSS6Q8IU80 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMPRSS6Q8IU80 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMPRSS6Q8IU80 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMPRSS6Q8IU80 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMPRSS6Q8IU80 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMPRSS6Q8IU80 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMPRSS6Q8IU80 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMPRSS6Q8IU80 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMPRSS6Q8IU80 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMPRSS6Q8IU80 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMPRSS6Q8IU80 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms