Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT5

PDZD3, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD3Q86UT5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDZD3Q86UT5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDZD3Q86UT5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDZD3Q86UT5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDZD3Q86UT5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PDZD3Q86UT5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDZD3Q86UT5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDZD3Q86UT5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDZD3Q86UT5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDZD3Q86UT5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZD3Q86UT5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDZD3Q86UT5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDZD3Q86UT5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDZD3Q86UT5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDZD3Q86UT5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDZD3Q86UT5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PDZD3Q86UT5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDZD3Q86UT5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDZD3Q86UT5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDZD3Q86UT5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDZD3Q86UT5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDZD3Q86UT5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PDZD3Q86UT5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PDZD3Q86UT5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDZD3Q86UT5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PDZD3Q86UT5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDZD3Q86UT5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDZD3Q86UT5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDZD3Q86UT5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDZD3Q86UT5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDZD3Q86UT5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDZD3Q86UT5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDZD3Q86UT5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDZD3Q86UT5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDZD3Q86UT5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDZD3Q86UT5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDZD3Q86UT5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDZD3Q86UT5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDZD3Q86UT5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDZD3Q86UT5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDZD3Q86UT5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDZD3Q86UT5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDZD3Q86UT5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDZD3Q86UT5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDZD3Q86UT5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDZD3Q86UT5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDZD3Q86UT5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDZD3Q86UT5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDZD3Q86UT5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDZD3Q86UT5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PDZD3Q86UT5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDZD3Q86UT5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDZD3Q86UT5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PDZD3Q86UT5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDZD3Q86UT5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDZD3Q86UT5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDZD3Q86UT5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDZD3Q86UT5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDZD3Q86UT5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDZD3Q86UT5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDZD3Q86UT5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PDZD3Q86UT5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDZD3Q86UT5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDZD3Q86UT5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDZD3Q86UT5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDZD3Q86UT5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDZD3Q86UT5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDZD3Q86UT5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDZD3Q86UT5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PDZD3Q86UT5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDZD3Q86UT5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDZD3Q86UT5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDZD3Q86UT5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDZD3Q86UT5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDZD3Q86UT5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDZD3Q86UT5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDZD3Q86UT5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDZD3Q86UT5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDZD3Q86UT5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDZD3Q86UT5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDZD3Q86UT5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PDZD3Q86UT5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PDZD3Q86UT5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDZD3Q86UT5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDZD3Q86UT5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDZD3Q86UT5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDZD3Q86UT5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDZD3Q86UT5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDZD3Q86UT5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDZD3Q86UT5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDZD3Q86UT5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDZD3Q86UT5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDZD3Q86UT5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDZD3Q86UT5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDZD3Q86UT5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDZD3Q86UT5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDZD3Q86UT5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDZD3Q86UT5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDZD3Q86UT5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDZD3Q86UT5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms