Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5N4

SDK1, Protein sidekick-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK1Q7Z5N4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SDK1Q7Z5N4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SDK1Q7Z5N4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SDK1Q7Z5N4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SDK1Q7Z5N4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SDK1Q7Z5N4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SDK1Q7Z5N4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SDK1Q7Z5N4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SDK1Q7Z5N4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SDK1Q7Z5N4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SDK1Q7Z5N4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SDK1Q7Z5N4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SDK1Q7Z5N4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SDK1Q7Z5N4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SDK1Q7Z5N4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
SDK1Q7Z5N4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SDK1Q7Z5N4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SDK1Q7Z5N4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SDK1Q7Z5N4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SDK1Q7Z5N4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SDK1Q7Z5N4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SDK1Q7Z5N4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SDK1Q7Z5N4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SDK1Q7Z5N4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SDK1Q7Z5N4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SDK1Q7Z5N4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SDK1Q7Z5N4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SDK1Q7Z5N4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SDK1Q7Z5N4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SDK1Q7Z5N4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SDK1Q7Z5N4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SDK1Q7Z5N4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SDK1Q7Z5N4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SDK1Q7Z5N4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SDK1Q7Z5N4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SDK1Q7Z5N4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SDK1Q7Z5N4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SDK1Q7Z5N4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SDK1Q7Z5N4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SDK1Q7Z5N4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SDK1Q7Z5N4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SDK1Q7Z5N4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SDK1Q7Z5N4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SDK1Q7Z5N4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SDK1Q7Z5N4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SDK1Q7Z5N4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SDK1Q7Z5N4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SDK1Q7Z5N4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SDK1Q7Z5N4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SDK1Q7Z5N4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
SDK1Q7Z5N4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SDK1Q7Z5N4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SDK1Q7Z5N4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SDK1Q7Z5N4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SDK1Q7Z5N4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SDK1Q7Z5N4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SDK1Q7Z5N4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SDK1Q7Z5N4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SDK1Q7Z5N4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SDK1Q7Z5N4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SDK1Q7Z5N4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SDK1Q7Z5N4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SDK1Q7Z5N4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SDK1Q7Z5N4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SDK1Q7Z5N4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SDK1Q7Z5N4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SDK1Q7Z5N4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SDK1Q7Z5N4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SDK1Q7Z5N4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SDK1Q7Z5N4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SDK1Q7Z5N4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SDK1Q7Z5N4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SDK1Q7Z5N4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SDK1Q7Z5N4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SDK1Q7Z5N4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SDK1Q7Z5N4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SDK1Q7Z5N4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SDK1Q7Z5N4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SDK1Q7Z5N4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SDK1Q7Z5N4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SDK1Q7Z5N4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SDK1Q7Z5N4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SDK1Q7Z5N4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SDK1Q7Z5N4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SDK1Q7Z5N4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SDK1Q7Z5N4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SDK1Q7Z5N4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SDK1Q7Z5N4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SDK1Q7Z5N4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SDK1Q7Z5N4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SDK1Q7Z5N4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SDK1Q7Z5N4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SDK1Q7Z5N4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SDK1Q7Z5N4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SDK1Q7Z5N4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SDK1Q7Z5N4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SDK1Q7Z5N4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SDK1Q7Z5N4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SDK1Q7Z5N4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SDK1Q7Z5N4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms