Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3T8

ZFYVE16, Zinc finger FYVE domain-containing protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE16Q7Z3T8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC42.08■■■■■ 4.33
ZFYVE16Q7Z3T8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
ZFYVE16Q7Z3T8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
ZFYVE16Q7Z3T8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC42.02■■■■■ 4.32
ZFYVE16Q7Z3T8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC42.01■■■■■ 4.32
ZFYVE16Q7Z3T8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
ZFYVE16Q7Z3T8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
ZFYVE16Q7Z3T8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
ZFYVE16Q7Z3T8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC42■■■■■ 4.31
ZFYVE16Q7Z3T8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
ZFYVE16Q7Z3T8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
ZFYVE16Q7Z3T8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
ZFYVE16Q7Z3T8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
ZFYVE16Q7Z3T8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
ZFYVE16Q7Z3T8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
ZFYVE16Q7Z3T8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC41.92■■■■■ 4.3
ZFYVE16Q7Z3T8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
ZFYVE16Q7Z3T8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.29
ZFYVE16Q7Z3T8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.29
ZFYVE16Q7Z3T8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.29
ZFYVE16Q7Z3T8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
ZFYVE16Q7Z3T8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC41.87■■■■■ 4.29
ZFYVE16Q7Z3T8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
ZFYVE16Q7Z3T8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
ZFYVE16Q7Z3T8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
ZFYVE16Q7Z3T8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
ZFYVE16Q7Z3T8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
ZFYVE16Q7Z3T8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
ZFYVE16Q7Z3T8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
ZFYVE16Q7Z3T8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
ZFYVE16Q7Z3T8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
ZFYVE16Q7Z3T8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
ZFYVE16Q7Z3T8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
ZFYVE16Q7Z3T8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
ZFYVE16Q7Z3T8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
ZFYVE16Q7Z3T8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC41.75■■■■■ 4.27
ZFYVE16Q7Z3T8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
ZFYVE16Q7Z3T8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC41.74■■■■■ 4.27
ZFYVE16Q7Z3T8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
ZFYVE16Q7Z3T8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
ZFYVE16Q7Z3T8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC41.7■■■■■ 4.27
ZFYVE16Q7Z3T8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC41.67■■■■■ 4.26
ZFYVE16Q7Z3T8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
ZFYVE16Q7Z3T8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
ZFYVE16Q7Z3T8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
ZFYVE16Q7Z3T8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC41.65■■■■■ 4.26
ZFYVE16Q7Z3T8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
ZFYVE16Q7Z3T8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
ZFYVE16Q7Z3T8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
ZFYVE16Q7Z3T8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
ZFYVE16Q7Z3T8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC41.58■■■■■ 4.25
ZFYVE16Q7Z3T8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
ZFYVE16Q7Z3T8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC41.58■■■■■ 4.25
ZFYVE16Q7Z3T8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
ZFYVE16Q7Z3T8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
ZFYVE16Q7Z3T8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
ZFYVE16Q7Z3T8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC41.55■■■■■ 4.24
ZFYVE16Q7Z3T8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
ZFYVE16Q7Z3T8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
ZFYVE16Q7Z3T8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
ZFYVE16Q7Z3T8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
ZFYVE16Q7Z3T8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
ZFYVE16Q7Z3T8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
ZFYVE16Q7Z3T8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC41.51■■■■■ 4.24
ZFYVE16Q7Z3T8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.23
ZFYVE16Q7Z3T8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
ZFYVE16Q7Z3T8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
ZFYVE16Q7Z3T8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC41.49■■■■■ 4.23
ZFYVE16Q7Z3T8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
ZFYVE16Q7Z3T8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
ZFYVE16Q7Z3T8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
ZFYVE16Q7Z3T8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
ZFYVE16Q7Z3T8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.23
ZFYVE16Q7Z3T8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.22
ZFYVE16Q7Z3T8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
ZFYVE16Q7Z3T8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
ZFYVE16Q7Z3T8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
ZFYVE16Q7Z3T8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC41.36■■■■■ 4.21
ZFYVE16Q7Z3T8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
ZFYVE16Q7Z3T8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
ZFYVE16Q7Z3T8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
ZFYVE16Q7Z3T8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
ZFYVE16Q7Z3T8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
ZFYVE16Q7Z3T8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
ZFYVE16Q7Z3T8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC41.3■■■■■ 4.2
ZFYVE16Q7Z3T8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
ZFYVE16Q7Z3T8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
ZFYVE16Q7Z3T8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
ZFYVE16Q7Z3T8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
ZFYVE16Q7Z3T8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
ZFYVE16Q7Z3T8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC41.27■■■■■ 4.2
ZFYVE16Q7Z3T8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
ZFYVE16Q7Z3T8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC41.26■■■■■ 4.2
ZFYVE16Q7Z3T8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
ZFYVE16Q7Z3T8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
ZFYVE16Q7Z3T8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
ZFYVE16Q7Z3T8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
ZFYVE16Q7Z3T8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC41.23■■■■■ 4.19
ZFYVE16Q7Z3T8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
ZFYVE16Q7Z3T8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms