Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2R9

SSBP3-AS1, Putative uncharacterized protein SSBP3-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP3-AS1Q7Z2R9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP3-AS1Q7Z2R9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP3-AS1Q7Z2R9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP3-AS1Q7Z2R9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP3-AS1Q7Z2R9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP3-AS1Q7Z2R9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP3-AS1Q7Z2R9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP3-AS1Q7Z2R9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SSBP3-AS1Q7Z2R9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP3-AS1Q7Z2R9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP3-AS1Q7Z2R9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSBP3-AS1Q7Z2R9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP3-AS1Q7Z2R9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP3-AS1Q7Z2R9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP3-AS1Q7Z2R9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3-AS1Q7Z2R9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP3-AS1Q7Z2R9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP3-AS1Q7Z2R9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP3-AS1Q7Z2R9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP3-AS1Q7Z2R9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP3-AS1Q7Z2R9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP3-AS1Q7Z2R9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP3-AS1Q7Z2R9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP3-AS1Q7Z2R9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP3-AS1Q7Z2R9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP3-AS1Q7Z2R9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP3-AS1Q7Z2R9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP3-AS1Q7Z2R9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP3-AS1Q7Z2R9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP3-AS1Q7Z2R9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP3-AS1Q7Z2R9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SSBP3-AS1Q7Z2R9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP3-AS1Q7Z2R9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SSBP3-AS1Q7Z2R9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP3-AS1Q7Z2R9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP3-AS1Q7Z2R9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP3-AS1Q7Z2R9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SSBP3-AS1Q7Z2R9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP3-AS1Q7Z2R9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP3-AS1Q7Z2R9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP3-AS1Q7Z2R9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP3-AS1Q7Z2R9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP3-AS1Q7Z2R9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSBP3-AS1Q7Z2R9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSBP3-AS1Q7Z2R9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP3-AS1Q7Z2R9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP3-AS1Q7Z2R9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP3-AS1Q7Z2R9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP3-AS1Q7Z2R9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP3-AS1Q7Z2R9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP3-AS1Q7Z2R9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP3-AS1Q7Z2R9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP3-AS1Q7Z2R9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP3-AS1Q7Z2R9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP3-AS1Q7Z2R9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP3-AS1Q7Z2R9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP3-AS1Q7Z2R9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP3-AS1Q7Z2R9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP3-AS1Q7Z2R9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP3-AS1Q7Z2R9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP3-AS1Q7Z2R9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms