Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
OTOP1Q7RTM1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
OTOP1Q7RTM1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
OTOP1Q7RTM1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
OTOP1Q7RTM1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
OTOP1Q7RTM1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
OTOP1Q7RTM1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
OTOP1Q7RTM1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
OTOP1Q7RTM1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
OTOP1Q7RTM1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
OTOP1Q7RTM1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
OTOP1Q7RTM1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
OTOP1Q7RTM1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
OTOP1Q7RTM1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
OTOP1Q7RTM1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
OTOP1Q7RTM1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
OTOP1Q7RTM1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
OTOP1Q7RTM1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
OTOP1Q7RTM1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
OTOP1Q7RTM1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
OTOP1Q7RTM1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
OTOP1Q7RTM1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
OTOP1Q7RTM1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
OTOP1Q7RTM1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
OTOP1Q7RTM1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
OTOP1Q7RTM1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
OTOP1Q7RTM1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
OTOP1Q7RTM1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
OTOP1Q7RTM1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
OTOP1Q7RTM1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.8■■■□□ 2.68
OTOP1Q7RTM1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
OTOP1Q7RTM1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
OTOP1Q7RTM1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
OTOP1Q7RTM1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
OTOP1Q7RTM1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
OTOP1Q7RTM1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
OTOP1Q7RTM1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
OTOP1Q7RTM1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
OTOP1Q7RTM1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
OTOP1Q7RTM1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
OTOP1Q7RTM1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
OTOP1Q7RTM1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
OTOP1Q7RTM1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
OTOP1Q7RTM1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
OTOP1Q7RTM1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
OTOP1Q7RTM1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
OTOP1Q7RTM1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.66
OTOP1Q7RTM1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.69■■■□□ 2.66
OTOP1Q7RTM1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
OTOP1Q7RTM1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
OTOP1Q7RTM1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
OTOP1Q7RTM1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
OTOP1Q7RTM1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
OTOP1Q7RTM1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
OTOP1Q7RTM1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
OTOP1Q7RTM1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
OTOP1Q7RTM1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
OTOP1Q7RTM1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
OTOP1Q7RTM1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
OTOP1Q7RTM1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
OTOP1Q7RTM1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
OTOP1Q7RTM1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
OTOP1Q7RTM1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
OTOP1Q7RTM1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
OTOP1Q7RTM1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
OTOP1Q7RTM1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
OTOP1Q7RTM1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
OTOP1Q7RTM1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
OTOP1Q7RTM1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
OTOP1Q7RTM1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
OTOP1Q7RTM1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
OTOP1Q7RTM1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
OTOP1Q7RTM1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
OTOP1Q7RTM1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
OTOP1Q7RTM1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31.55■■■□□ 2.64
OTOP1Q7RTM1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
OTOP1Q7RTM1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
OTOP1Q7RTM1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
OTOP1Q7RTM1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
OTOP1Q7RTM1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
OTOP1Q7RTM1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
OTOP1Q7RTM1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
OTOP1Q7RTM1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
OTOP1Q7RTM1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
OTOP1Q7RTM1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
OTOP1Q7RTM1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
OTOP1Q7RTM1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
OTOP1Q7RTM1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
OTOP1Q7RTM1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
OTOP1Q7RTM1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
OTOP1Q7RTM1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
OTOP1Q7RTM1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
OTOP1Q7RTM1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
OTOP1Q7RTM1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
OTOP1Q7RTM1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
OTOP1Q7RTM1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
OTOP1Q7RTM1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
OTOP1Q7RTM1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
OTOP1Q7RTM1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
OTOP1Q7RTM1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms