Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SMIM5Q71RC9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SMIM5Q71RC9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SMIM5Q71RC9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SMIM5Q71RC9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SMIM5Q71RC9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SMIM5Q71RC9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SMIM5Q71RC9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SMIM5Q71RC9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SMIM5Q71RC9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SMIM5Q71RC9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SMIM5Q71RC9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
SMIM5Q71RC9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SMIM5Q71RC9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SMIM5Q71RC9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SMIM5Q71RC9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SMIM5Q71RC9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SMIM5Q71RC9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SMIM5Q71RC9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SMIM5Q71RC9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SMIM5Q71RC9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SMIM5Q71RC9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SMIM5Q71RC9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SMIM5Q71RC9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SMIM5Q71RC9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SMIM5Q71RC9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
SMIM5Q71RC9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SMIM5Q71RC9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SMIM5Q71RC9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SMIM5Q71RC9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SMIM5Q71RC9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SMIM5Q71RC9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SMIM5Q71RC9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SMIM5Q71RC9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SMIM5Q71RC9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
SMIM5Q71RC9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SMIM5Q71RC9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SMIM5Q71RC9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SMIM5Q71RC9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SMIM5Q71RC9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SMIM5Q71RC9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
SMIM5Q71RC9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SMIM5Q71RC9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SMIM5Q71RC9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
SMIM5Q71RC9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
SMIM5Q71RC9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
SMIM5Q71RC9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC35■■■■□ 3.19
SMIM5Q71RC9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SMIM5Q71RC9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SMIM5Q71RC9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SMIM5Q71RC9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SMIM5Q71RC9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SMIM5Q71RC9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SMIM5Q71RC9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
SMIM5Q71RC9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SMIM5Q71RC9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SMIM5Q71RC9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SMIM5Q71RC9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
SMIM5Q71RC9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SMIM5Q71RC9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SMIM5Q71RC9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SMIM5Q71RC9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SMIM5Q71RC9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SMIM5Q71RC9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SMIM5Q71RC9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SMIM5Q71RC9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
SMIM5Q71RC9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SMIM5Q71RC9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SMIM5Q71RC9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
SMIM5Q71RC9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SMIM5Q71RC9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SMIM5Q71RC9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
SMIM5Q71RC9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
SMIM5Q71RC9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SMIM5Q71RC9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SMIM5Q71RC9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
SMIM5Q71RC9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC34.76■■■■□ 3.16
SMIM5Q71RC9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SMIM5Q71RC9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SMIM5Q71RC9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SMIM5Q71RC9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SMIM5Q71RC9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
SMIM5Q71RC9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SMIM5Q71RC9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SMIM5Q71RC9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SMIM5Q71RC9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SMIM5Q71RC9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SMIM5Q71RC9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SMIM5Q71RC9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SMIM5Q71RC9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SMIM5Q71RC9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
SMIM5Q71RC9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SMIM5Q71RC9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SMIM5Q71RC9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SMIM5Q71RC9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SMIM5Q71RC9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SMIM5Q71RC9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SMIM5Q71RC9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SMIM5Q71RC9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SMIM5Q71RC9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms