Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJG9

LRFN4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN4Q6PJG9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRFN4Q6PJG9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRFN4Q6PJG9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRFN4Q6PJG9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRFN4Q6PJG9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRFN4Q6PJG9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRFN4Q6PJG9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRFN4Q6PJG9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LRFN4Q6PJG9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRFN4Q6PJG9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRFN4Q6PJG9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRFN4Q6PJG9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRFN4Q6PJG9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRFN4Q6PJG9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRFN4Q6PJG9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRFN4Q6PJG9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRFN4Q6PJG9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRFN4Q6PJG9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRFN4Q6PJG9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRFN4Q6PJG9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRFN4Q6PJG9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRFN4Q6PJG9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRFN4Q6PJG9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRFN4Q6PJG9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRFN4Q6PJG9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRFN4Q6PJG9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRFN4Q6PJG9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRFN4Q6PJG9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRFN4Q6PJG9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRFN4Q6PJG9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRFN4Q6PJG9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRFN4Q6PJG9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRFN4Q6PJG9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRFN4Q6PJG9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRFN4Q6PJG9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRFN4Q6PJG9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRFN4Q6PJG9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRFN4Q6PJG9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRFN4Q6PJG9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRFN4Q6PJG9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LRFN4Q6PJG9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRFN4Q6PJG9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRFN4Q6PJG9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRFN4Q6PJG9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRFN4Q6PJG9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRFN4Q6PJG9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRFN4Q6PJG9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRFN4Q6PJG9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRFN4Q6PJG9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRFN4Q6PJG9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRFN4Q6PJG9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRFN4Q6PJG9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRFN4Q6PJG9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRFN4Q6PJG9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LRFN4Q6PJG9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRFN4Q6PJG9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LRFN4Q6PJG9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRFN4Q6PJG9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRFN4Q6PJG9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRFN4Q6PJG9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRFN4Q6PJG9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRFN4Q6PJG9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRFN4Q6PJG9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRFN4Q6PJG9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRFN4Q6PJG9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRFN4Q6PJG9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRFN4Q6PJG9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRFN4Q6PJG9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRFN4Q6PJG9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRFN4Q6PJG9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LRFN4Q6PJG9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRFN4Q6PJG9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRFN4Q6PJG9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LRFN4Q6PJG9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRFN4Q6PJG9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRFN4Q6PJG9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRFN4Q6PJG9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRFN4Q6PJG9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LRFN4Q6PJG9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LRFN4Q6PJG9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRFN4Q6PJG9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRFN4Q6PJG9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRFN4Q6PJG9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRFN4Q6PJG9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRFN4Q6PJG9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRFN4Q6PJG9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRFN4Q6PJG9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRFN4Q6PJG9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRFN4Q6PJG9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRFN4Q6PJG9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRFN4Q6PJG9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRFN4Q6PJG9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRFN4Q6PJG9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRFN4Q6PJG9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRFN4Q6PJG9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRFN4Q6PJG9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LRFN4Q6PJG9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRFN4Q6PJG9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRFN4Q6PJG9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRFN4Q6PJG9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms