Protein–RNA interactions for Protein: Q659A1

ICE2, Little elongation complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ICE2Q659A1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ICE2Q659A1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ICE2Q659A1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ICE2Q659A1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ICE2Q659A1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ICE2Q659A1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ICE2Q659A1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ICE2Q659A1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ICE2Q659A1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ICE2Q659A1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ICE2Q659A1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ICE2Q659A1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ICE2Q659A1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ICE2Q659A1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ICE2Q659A1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ICE2Q659A1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ICE2Q659A1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ICE2Q659A1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ICE2Q659A1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ICE2Q659A1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ICE2Q659A1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ICE2Q659A1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ICE2Q659A1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ICE2Q659A1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ICE2Q659A1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ICE2Q659A1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ICE2Q659A1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ICE2Q659A1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ICE2Q659A1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ICE2Q659A1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ICE2Q659A1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ICE2Q659A1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ICE2Q659A1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ICE2Q659A1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ICE2Q659A1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ICE2Q659A1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ICE2Q659A1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ICE2Q659A1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ICE2Q659A1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ICE2Q659A1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ICE2Q659A1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ICE2Q659A1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ICE2Q659A1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ICE2Q659A1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ICE2Q659A1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ICE2Q659A1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ICE2Q659A1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ICE2Q659A1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ICE2Q659A1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ICE2Q659A1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ICE2Q659A1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ICE2Q659A1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ICE2Q659A1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ICE2Q659A1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ICE2Q659A1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ICE2Q659A1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ICE2Q659A1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ICE2Q659A1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ICE2Q659A1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ICE2Q659A1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ICE2Q659A1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ICE2Q659A1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ICE2Q659A1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ICE2Q659A1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ICE2Q659A1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ICE2Q659A1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ICE2Q659A1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ICE2Q659A1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ICE2Q659A1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ICE2Q659A1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ICE2Q659A1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ICE2Q659A1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ICE2Q659A1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ICE2Q659A1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ICE2Q659A1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ICE2Q659A1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ICE2Q659A1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ICE2Q659A1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ICE2Q659A1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ICE2Q659A1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ICE2Q659A1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ICE2Q659A1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ICE2Q659A1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ICE2Q659A1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ICE2Q659A1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ICE2Q659A1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ICE2Q659A1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ICE2Q659A1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ICE2Q659A1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ICE2Q659A1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ICE2Q659A1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ICE2Q659A1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ICE2Q659A1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ICE2Q659A1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ICE2Q659A1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ICE2Q659A1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ICE2Q659A1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ICE2Q659A1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ICE2Q659A1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ICE2Q659A1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms