Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG99

LYSMD4, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD4Q5XG99 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LYSMD4Q5XG99 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LYSMD4Q5XG99 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LYSMD4Q5XG99 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LYSMD4Q5XG99 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LYSMD4Q5XG99 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LYSMD4Q5XG99 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LYSMD4Q5XG99 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LYSMD4Q5XG99 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LYSMD4Q5XG99 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LYSMD4Q5XG99 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LYSMD4Q5XG99 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LYSMD4Q5XG99 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LYSMD4Q5XG99 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LYSMD4Q5XG99 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LYSMD4Q5XG99 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LYSMD4Q5XG99 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LYSMD4Q5XG99 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LYSMD4Q5XG99 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LYSMD4Q5XG99 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LYSMD4Q5XG99 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LYSMD4Q5XG99 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LYSMD4Q5XG99 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LYSMD4Q5XG99 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LYSMD4Q5XG99 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LYSMD4Q5XG99 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LYSMD4Q5XG99 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LYSMD4Q5XG99 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LYSMD4Q5XG99 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LYSMD4Q5XG99 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LYSMD4Q5XG99 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LYSMD4Q5XG99 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LYSMD4Q5XG99 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LYSMD4Q5XG99 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LYSMD4Q5XG99 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LYSMD4Q5XG99 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LYSMD4Q5XG99 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LYSMD4Q5XG99 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LYSMD4Q5XG99 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LYSMD4Q5XG99 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LYSMD4Q5XG99 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LYSMD4Q5XG99 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LYSMD4Q5XG99 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LYSMD4Q5XG99 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LYSMD4Q5XG99 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LYSMD4Q5XG99 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LYSMD4Q5XG99 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LYSMD4Q5XG99 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LYSMD4Q5XG99 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LYSMD4Q5XG99 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LYSMD4Q5XG99 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LYSMD4Q5XG99 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LYSMD4Q5XG99 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LYSMD4Q5XG99 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LYSMD4Q5XG99 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LYSMD4Q5XG99 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LYSMD4Q5XG99 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LYSMD4Q5XG99 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LYSMD4Q5XG99 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LYSMD4Q5XG99 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
LYSMD4Q5XG99 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LYSMD4Q5XG99 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LYSMD4Q5XG99 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LYSMD4Q5XG99 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LYSMD4Q5XG99 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LYSMD4Q5XG99 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LYSMD4Q5XG99 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LYSMD4Q5XG99 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LYSMD4Q5XG99 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LYSMD4Q5XG99 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LYSMD4Q5XG99 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LYSMD4Q5XG99 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LYSMD4Q5XG99 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LYSMD4Q5XG99 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LYSMD4Q5XG99 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LYSMD4Q5XG99 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LYSMD4Q5XG99 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LYSMD4Q5XG99 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LYSMD4Q5XG99 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LYSMD4Q5XG99 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LYSMD4Q5XG99 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LYSMD4Q5XG99 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LYSMD4Q5XG99 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LYSMD4Q5XG99 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LYSMD4Q5XG99 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LYSMD4Q5XG99 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LYSMD4Q5XG99 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LYSMD4Q5XG99 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LYSMD4Q5XG99 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LYSMD4Q5XG99 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LYSMD4Q5XG99 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LYSMD4Q5XG99 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LYSMD4Q5XG99 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LYSMD4Q5XG99 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LYSMD4Q5XG99 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LYSMD4Q5XG99 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LYSMD4Q5XG99 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LYSMD4Q5XG99 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LYSMD4Q5XG99 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LYSMD4Q5XG99 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms