Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ89

DENND4C, DENN domain-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4CQ5VZ89 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DENND4CQ5VZ89 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
DENND4CQ5VZ89 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DENND4CQ5VZ89 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DENND4CQ5VZ89 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DENND4CQ5VZ89 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DENND4CQ5VZ89 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DENND4CQ5VZ89 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DENND4CQ5VZ89 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DENND4CQ5VZ89 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DENND4CQ5VZ89 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DENND4CQ5VZ89 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DENND4CQ5VZ89 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DENND4CQ5VZ89 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DENND4CQ5VZ89 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DENND4CQ5VZ89 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DENND4CQ5VZ89 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DENND4CQ5VZ89 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DENND4CQ5VZ89 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DENND4CQ5VZ89 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DENND4CQ5VZ89 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DENND4CQ5VZ89 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DENND4CQ5VZ89 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DENND4CQ5VZ89 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DENND4CQ5VZ89 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DENND4CQ5VZ89 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DENND4CQ5VZ89 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DENND4CQ5VZ89 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DENND4CQ5VZ89 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DENND4CQ5VZ89 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DENND4CQ5VZ89 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DENND4CQ5VZ89 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DENND4CQ5VZ89 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DENND4CQ5VZ89 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DENND4CQ5VZ89 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DENND4CQ5VZ89 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DENND4CQ5VZ89 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DENND4CQ5VZ89 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DENND4CQ5VZ89 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DENND4CQ5VZ89 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DENND4CQ5VZ89 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DENND4CQ5VZ89 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DENND4CQ5VZ89 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DENND4CQ5VZ89 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DENND4CQ5VZ89 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DENND4CQ5VZ89 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DENND4CQ5VZ89 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DENND4CQ5VZ89 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DENND4CQ5VZ89 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DENND4CQ5VZ89 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DENND4CQ5VZ89 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DENND4CQ5VZ89 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DENND4CQ5VZ89 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DENND4CQ5VZ89 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DENND4CQ5VZ89 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DENND4CQ5VZ89 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DENND4CQ5VZ89 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DENND4CQ5VZ89 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DENND4CQ5VZ89 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DENND4CQ5VZ89 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DENND4CQ5VZ89 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DENND4CQ5VZ89 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DENND4CQ5VZ89 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DENND4CQ5VZ89 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DENND4CQ5VZ89 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DENND4CQ5VZ89 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DENND4CQ5VZ89 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DENND4CQ5VZ89 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DENND4CQ5VZ89 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DENND4CQ5VZ89 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
DENND4CQ5VZ89 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DENND4CQ5VZ89 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
DENND4CQ5VZ89 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DENND4CQ5VZ89 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DENND4CQ5VZ89 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DENND4CQ5VZ89 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DENND4CQ5VZ89 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DENND4CQ5VZ89 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DENND4CQ5VZ89 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DENND4CQ5VZ89 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DENND4CQ5VZ89 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DENND4CQ5VZ89 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
DENND4CQ5VZ89 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DENND4CQ5VZ89 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DENND4CQ5VZ89 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DENND4CQ5VZ89 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DENND4CQ5VZ89 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DENND4CQ5VZ89 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DENND4CQ5VZ89 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DENND4CQ5VZ89 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DENND4CQ5VZ89 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DENND4CQ5VZ89 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DENND4CQ5VZ89 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
DENND4CQ5VZ89 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DENND4CQ5VZ89 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DENND4CQ5VZ89 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DENND4CQ5VZ89 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DENND4CQ5VZ89 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DENND4CQ5VZ89 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DENND4CQ5VZ89 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms