Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
CEP350Q5VT06 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CEP350Q5VT06 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CEP350Q5VT06 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CEP350Q5VT06 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CEP350Q5VT06 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
CEP350Q5VT06 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CEP350Q5VT06 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CEP350Q5VT06 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CEP350Q5VT06 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CEP350Q5VT06 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CEP350Q5VT06 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
CEP350Q5VT06 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CEP350Q5VT06 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CEP350Q5VT06 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CEP350Q5VT06 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CEP350Q5VT06 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CEP350Q5VT06 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CEP350Q5VT06 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CEP350Q5VT06 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CEP350Q5VT06 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CEP350Q5VT06 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CEP350Q5VT06 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CEP350Q5VT06 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CEP350Q5VT06 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CEP350Q5VT06 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CEP350Q5VT06 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CEP350Q5VT06 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CEP350Q5VT06 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CEP350Q5VT06 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CEP350Q5VT06 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CEP350Q5VT06 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CEP350Q5VT06 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CEP350Q5VT06 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CEP350Q5VT06 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CEP350Q5VT06 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CEP350Q5VT06 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CEP350Q5VT06 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
CEP350Q5VT06 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CEP350Q5VT06 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CEP350Q5VT06 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CEP350Q5VT06 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CEP350Q5VT06 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CEP350Q5VT06 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CEP350Q5VT06 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CEP350Q5VT06 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CEP350Q5VT06 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CEP350Q5VT06 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
CEP350Q5VT06 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CEP350Q5VT06 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CEP350Q5VT06 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CEP350Q5VT06 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CEP350Q5VT06 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CEP350Q5VT06 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CEP350Q5VT06 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CEP350Q5VT06 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CEP350Q5VT06 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CEP350Q5VT06 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
CEP350Q5VT06 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CEP350Q5VT06 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CEP350Q5VT06 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
CEP350Q5VT06 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CEP350Q5VT06 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CEP350Q5VT06 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CEP350Q5VT06 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CEP350Q5VT06 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CEP350Q5VT06 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CEP350Q5VT06 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
CEP350Q5VT06 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CEP350Q5VT06 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CEP350Q5VT06 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CEP350Q5VT06 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CEP350Q5VT06 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CEP350Q5VT06 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CEP350Q5VT06 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CEP350Q5VT06 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CEP350Q5VT06 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CEP350Q5VT06 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
CEP350Q5VT06 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CEP350Q5VT06 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CEP350Q5VT06 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CEP350Q5VT06 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
CEP350Q5VT06 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CEP350Q5VT06 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CEP350Q5VT06 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CEP350Q5VT06 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CEP350Q5VT06 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
CEP350Q5VT06 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
CEP350Q5VT06 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
CEP350Q5VT06 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
CEP350Q5VT06 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CEP350Q5VT06 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CEP350Q5VT06 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CEP350Q5VT06 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
CEP350Q5VT06 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CEP350Q5VT06 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CEP350Q5VT06 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CEP350Q5VT06 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CEP350Q5VT06 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CEP350Q5VT06 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms