Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PIK3CD-AS1Q5SR53 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PIK3CD-AS1Q5SR53 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PIK3CD-AS1Q5SR53 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PIK3CD-AS1Q5SR53 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PIK3CD-AS1Q5SR53 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PIK3CD-AS1Q5SR53 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PIK3CD-AS1Q5SR53 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PIK3CD-AS1Q5SR53 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PIK3CD-AS1Q5SR53 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PIK3CD-AS1Q5SR53 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PIK3CD-AS1Q5SR53 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PIK3CD-AS1Q5SR53 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PIK3CD-AS1Q5SR53 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PIK3CD-AS1Q5SR53 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PIK3CD-AS1Q5SR53 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PIK3CD-AS1Q5SR53 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PIK3CD-AS1Q5SR53 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PIK3CD-AS1Q5SR53 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PIK3CD-AS1Q5SR53 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PIK3CD-AS1Q5SR53 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PIK3CD-AS1Q5SR53 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PIK3CD-AS1Q5SR53 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PIK3CD-AS1Q5SR53 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PIK3CD-AS1Q5SR53 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PIK3CD-AS1Q5SR53 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PIK3CD-AS1Q5SR53 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PIK3CD-AS1Q5SR53 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PIK3CD-AS1Q5SR53 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PIK3CD-AS1Q5SR53 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PIK3CD-AS1Q5SR53 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PIK3CD-AS1Q5SR53 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PIK3CD-AS1Q5SR53 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIK3CD-AS1Q5SR53 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIK3CD-AS1Q5SR53 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIK3CD-AS1Q5SR53 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIK3CD-AS1Q5SR53 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIK3CD-AS1Q5SR53 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIK3CD-AS1Q5SR53 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3CD-AS1Q5SR53 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3CD-AS1Q5SR53 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3CD-AS1Q5SR53 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3CD-AS1Q5SR53 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PIK3CD-AS1Q5SR53 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PIK3CD-AS1Q5SR53 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PIK3CD-AS1Q5SR53 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PIK3CD-AS1Q5SR53 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PIK3CD-AS1Q5SR53 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PIK3CD-AS1Q5SR53 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PIK3CD-AS1Q5SR53 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PIK3CD-AS1Q5SR53 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PIK3CD-AS1Q5SR53 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PIK3CD-AS1Q5SR53 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PIK3CD-AS1Q5SR53 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PIK3CD-AS1Q5SR53 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PIK3CD-AS1Q5SR53 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PIK3CD-AS1Q5SR53 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PIK3CD-AS1Q5SR53 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PIK3CD-AS1Q5SR53 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PIK3CD-AS1Q5SR53 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PIK3CD-AS1Q5SR53 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3CD-AS1Q5SR53 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3CD-AS1Q5SR53 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3CD-AS1Q5SR53 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3CD-AS1Q5SR53 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3CD-AS1Q5SR53 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3CD-AS1Q5SR53 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3CD-AS1Q5SR53 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3CD-AS1Q5SR53 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3CD-AS1Q5SR53 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3CD-AS1Q5SR53 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3CD-AS1Q5SR53 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3CD-AS1Q5SR53 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3CD-AS1Q5SR53 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3CD-AS1Q5SR53 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3CD-AS1Q5SR53 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3CD-AS1Q5SR53 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3CD-AS1Q5SR53 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms